70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_45680 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  67.51 
 
 
551 aa  706    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  100 
 
 
533 aa  1075    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  56.65 
 
 
592 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  55.83 
 
 
567 aa  571  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  52.08 
 
 
539 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  51.88 
 
 
539 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  52.52 
 
 
1355 aa  482  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  50.99 
 
 
546 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  45.52 
 
 
629 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  48.37 
 
 
857 aa  452  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  46.61 
 
 
576 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  47.75 
 
 
600 aa  440  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  48.48 
 
 
774 aa  441  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  50.41 
 
 
1587 aa  440  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  45.12 
 
 
575 aa  432  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  45.66 
 
 
1322 aa  426  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  46.48 
 
 
633 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  45.02 
 
 
622 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  46.62 
 
 
624 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  45.76 
 
 
627 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  46.24 
 
 
624 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  46.43 
 
 
624 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  43.95 
 
 
624 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  43.82 
 
 
624 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  40.89 
 
 
598 aa  391  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  43.68 
 
 
624 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  45.09 
 
 
624 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  44.53 
 
 
624 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  43.55 
 
 
624 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  41.85 
 
 
635 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  43.3 
 
 
498 aa  353  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  37.33 
 
 
621 aa  348  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  38.86 
 
 
601 aa  335  9e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  42.38 
 
 
501 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  37.04 
 
 
622 aa  333  5e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  39.03 
 
 
589 aa  330  5.0000000000000004e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  38.66 
 
 
589 aa  329  8e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  40.98 
 
 
506 aa  329  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  41.1 
 
 
599 aa  327  5e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.19 
 
 
1795 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  37.94 
 
 
600 aa  310  5.9999999999999995e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  43.82 
 
 
2701 aa  298  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  42.2 
 
 
2182 aa  290  6e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  38.58 
 
 
2796 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  53.21 
 
 
1175 aa  275  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  31.46 
 
 
423 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.34 
 
 
3977 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.53 
 
 
1641 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  25.86 
 
 
775 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  34.15 
 
 
2852 aa  92.8  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.11 
 
 
1641 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  24.95 
 
 
754 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  25.51 
 
 
754 aa  87.8  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  23.77 
 
 
760 aa  87.4  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  24.9 
 
 
719 aa  78.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  25.05 
 
 
733 aa  73.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  27.02 
 
 
793 aa  70.5  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  22.51 
 
 
721 aa  68.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  26.07 
 
 
776 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  41.05 
 
 
723 aa  64.3  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  34.78 
 
 
723 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  34.78 
 
 
723 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  38.95 
 
 
720 aa  58.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  25.78 
 
 
721 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  33.57 
 
 
732 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  37.5 
 
 
732 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  33.09 
 
 
731 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1880  hypothetical protein  33.09 
 
 
453 aa  44.3  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  24.47 
 
 
729 aa  43.5  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.77 
 
 
1170 aa  43.5  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>