44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47869 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  100 
 
 
721 aa  1479    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  21.45 
 
 
633 aa  94  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  23.54 
 
 
1355 aa  82  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  25.18 
 
 
598 aa  80.9  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  22.17 
 
 
624 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  22.33 
 
 
624 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  22.03 
 
 
551 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  23.55 
 
 
624 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  21.28 
 
 
622 aa  71.6  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  23.83 
 
 
546 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  21.66 
 
 
576 aa  68.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  22.92 
 
 
533 aa  68.2  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  23.14 
 
 
600 aa  67.8  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  20.53 
 
 
575 aa  67.8  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  20.55 
 
 
635 aa  67  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  21.88 
 
 
624 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  21.75 
 
 
624 aa  65.1  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  22.56 
 
 
774 aa  65.1  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  22.67 
 
 
600 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  23.83 
 
 
629 aa  62  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  21.91 
 
 
498 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  25.37 
 
 
627 aa  59.3  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  20.55 
 
 
624 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  20.64 
 
 
624 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  20.64 
 
 
624 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  20.64 
 
 
624 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  22.57 
 
 
857 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.5 
 
 
1795 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  20.98 
 
 
622 aa  56.6  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  20.24 
 
 
592 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  20.74 
 
 
539 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  20.74 
 
 
539 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  24.31 
 
 
601 aa  53.5  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  22.42 
 
 
1175 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  21.3 
 
 
2701 aa  53.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  19.96 
 
 
621 aa  52.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  22.64 
 
 
1587 aa  51.2  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  20.97 
 
 
2182 aa  50.8  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  24.19 
 
 
589 aa  50.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.23 
 
 
1641 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  26.11 
 
 
732 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  26.05 
 
 
589 aa  48.5  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  24.82 
 
 
506 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  25.65 
 
 
723 aa  44.3  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>