93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1270 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 		 600 aa  1182    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 629 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  47.75 
 
 		 533 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  42.38 
 
 		 635 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  41.46 
 
 		 624 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  47.07 
 
 		 1355 aa  430  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  41.48 
 
 		 624 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  45.22 
 
 		 551 aa  425  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  44.16 
 
 		 592 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  41.32 
 
 		 624 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  44.89 
 
 		 539 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  41.49 
 
 		 624 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  40.54 
 
 		 624 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  44.7 
 
 		 539 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  41.93 
 
 		 624 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  41.32 
 
 		 624 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  42.63 
 
 		 627 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  46.7 
 
 		 774 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  46.55 
 
 		 1587 aa  402  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  40.32 
 
 		 624 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  40.28 
 
 		 624 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  45.95 
 
 		 546 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  41.65 
 
 		 633 aa  391  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  41.61 
 
 		 567 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  40.15 
 
 		 575 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  41.22 
 
 		 857 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  40.43 
 
 		 598 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  41.54 
 
 		 576 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  39.59 
 
 		 1322 aa  360  4e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  36.83 
 
 		 621 aa  358  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  38.97 
 
 		 622 aa  354  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  37.19 
 
 		 622 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  39.67 
 
 		 601 aa  344  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  35.94 
 
 		 600 aa  321  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  37.41 
 
 		 589 aa  320  5e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  37.64 
 
 		 589 aa  318  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  39.05 
 
 		 599 aa  317  3e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  39.22 
 
 		 501 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  36.96 
 
 		 498 aa  302  9e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.55 
 
 		 1795 aa  290  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  35.59 
 
 		 506 aa  284  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  40.58 
 
 		 2701 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  37.62 
 
 		 2182 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  52.38 
 
 		 1175 aa  256  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  36.01 
 
 		 2796 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  27.66 
 
 		 423 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.59 
 
 		 3977 aa  101  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  31.76 
 
 		 2852 aa  90.9  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  24.22 
 
 		 775 aa  89  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.98 
 
 		 1641 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  23.36 
 
 		 760 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  24.72 
 
 		 776 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.58 
 
 		 1641 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  24.39 
 
 		 793 aa  78.6  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  27.6 
 
 		 723 aa  77.8  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  23.22 
 
 		 754 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  25.07 
 
 		 754 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  26.2 
 
 		 733 aa  67.4  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  22.92 
 
 		 721 aa  65.1  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  22.86 
 
 		 719 aa  64.3  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  24.05 
 
 		 723 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  28.03 
 
 		 729 aa  62.4  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  24.05 
 
 		 723 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  25.17 
 
 		 721 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  27.71 
 
 		 729 aa  62  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  25.14 
 
 		 731 aa  56.2  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.19 
 
 		 348 aa  52.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  58 
 
 		 585 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0409  hypothetical protein  37.5 
 
 		 782 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  24.23 
 
 		 720 aa  48.9  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  26.59 
 
 		 732 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  28 
 
 		 462 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  51.92 
 
 		 813 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  24.74 
 
 		 732 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  50.94 
 
 		 1408 aa  46.6  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.81 
 
 		 347 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  50 
 
 		 2851 aa  46.2  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  54.72 
 
 		 582 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  56 
 
 		 512 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  54.72 
 
 		 587 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.44 
 
 		 689 aa  45.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  50.98 
 
 		 481 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  56.86 
 
 		 1426 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  49.12 
 
 		 580 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  50.98 
 
 		 478 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  51.92 
 
 		 347 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  51.92 
 
 		 347 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.53 
 
 		 328 aa  44.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.85 
 
 		 328 aa  44.3  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.27 
 
 		 328 aa  44.3  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.53 
 
 		 328 aa  43.9  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.62 
 
 		 348 aa  43.9  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  50 
 
 		 643 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>