98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2267 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  100 
 
 		 624 aa  1266    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  95.99 
 
 		 624 aa  1176    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  96.15 
 
 		 624 aa  1181    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  88.94 
 
 		 624 aa  1110    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  84.46 
 
 		 624 aa  1072    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  66.93 
 
 		 627 aa  785    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  81.73 
 
 		 624 aa  1026    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  84.78 
 
 		 624 aa  1077    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  84.62 
 
 		 624 aa  1059    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  84.62 
 
 		 624 aa  1074    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  63.87 
 
 		 635 aa  798    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 629 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  44.62 
 
 		 621 aa  450  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  47.16 
 
 		 592 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  40.86 
 
 		 600 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  43.01 
 
 		 622 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  46.62 
 
 		 533 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  42.3 
 
 		 600 aa  418  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  44.19 
 
 		 539 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  45.36 
 
 		 1355 aa  410  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  44.01 
 
 		 539 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  43.94 
 
 		 551 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  45.66 
 
 		 546 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  41.33 
 
 		 598 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  42.54 
 
 		 774 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  42.5 
 
 		 567 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  41.25 
 
 		 633 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  42.99 
 
 		 857 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  39.87 
 
 		 622 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  40.75 
 
 		 589 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  41.26 
 
 		 601 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  44.89 
 
 		 1587 aa  363  4e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  39.49 
 
 		 589 aa  359  8e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  39.96 
 
 		 1322 aa  352  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  41.31 
 
 		 576 aa  344  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  36.82 
 
 		 575 aa  343  5e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  37.43 
 
 		 498 aa  300  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  35.12 
 
 		 599 aa  298  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  38.92 
 
 		 501 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  39.08 
 
 		 506 aa  288  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  40.26 
 
 		 2182 aa  281  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  40.91 
 
 		 2701 aa  282  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  49.84 
 
 		 1175 aa  265  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  35.32 
 
 		 2796 aa  257  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.98 
 
 		 1795 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.47 
 
 		 3977 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  30.63 
 
 		 2852 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  25.67 
 
 		 423 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  22.33 
 
 		 721 aa  81.3  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  26.33 
 
 		 760 aa  80.5  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  24.19 
 
 		 723 aa  75.1  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0580  alkaline phosphatase  44.44 
 
 		 748 aa  75.1  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00489448 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  23.54 
 
 		 720 aa  74.7  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  24.71 
 
 		 775 aa  73.9  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.89 
 
 		 1641 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  24.32 
 
 		 733 aa  72.4  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  31.4 
 
 		 729 aa  72.8  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  30.92 
 
 		 729 aa  72.4  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  22.97 
 
 		 776 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  25 
 
 		 754 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  25 
 
 		 754 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.92 
 
 		 1641 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  42.39 
 
 		 640 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  24.28 
 
 		 731 aa  68.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  24.68 
 
 		 793 aa  66.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  23.06 
 
 		 719 aa  62.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  40.26 
 
 		 616 aa  61.6  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  22.99 
 
 		 723 aa  61.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  23.01 
 
 		 723 aa  61.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  25.14 
 
 		 732 aa  60.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  22.92 
 
 		 732 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.72 
 
 		 354 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.37 
 
 		 689 aa  55.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.56 
 
 		 347 aa  54.7  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  37.5 
 
 		 513 aa  53.9  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.52 
 
 		 348 aa  53.9  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.01 
 
 		 338 aa  53.5  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.61 
 
 		 334 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.78 
 
 		 348 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  21.6 
 
 		 721 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  37.5 
 
 		 513 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  37.5 
 
 		 513 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.69 
 
 		 348 aa  52.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  39.44 
 
 		 513 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  27.4 
 
 		 810 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.51 
 
 		 354 aa  49.7  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  34.29 
 
 		 556 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.17 
 
 		 366 aa  48.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  24.25 
 
 		 391 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.6 
 
 		 332 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 353 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.58 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.48 
 
 		 354 aa  45.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  24.12 
 
 		 580 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  29.45 
 
 		 819 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.06 
 
 		 327 aa  44.3  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.27 
 
 		 607 aa  44.3  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.42 
 
 		 345 aa  43.9  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>