92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2281 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  83.17 
 
 		 624 aa  1054    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  64.19 
 
 		 635 aa  795    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  100 
 
 		 624 aa  1265    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  83.49 
 
 		 624 aa  1038    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  83.65 
 
 		 624 aa  1058    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  79.81 
 
 		 624 aa  995    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  65.82 
 
 		 627 aa  772    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  82.69 
 
 		 624 aa  1048    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  88.94 
 
 		 624 aa  1110    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  89.74 
 
 		 624 aa  1092    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  90.06 
 
 		 624 aa  1099    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  41.64 
 
 		 621 aa  450  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 629 aa  438  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  46.18 
 
 		 592 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  39.75 
 
 		 600 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  41.78 
 
 		 622 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  43.85 
 
 		 551 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  45.09 
 
 		 533 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  43.07 
 
 		 539 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  39.84 
 
 		 600 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  42.97 
 
 		 539 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  44.1 
 
 		 1355 aa  395  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  43.93 
 
 		 546 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  41.36 
 
 		 567 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  42.55 
 
 		 857 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  40.92 
 
 		 633 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  41.88 
 
 		 598 aa  379  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  40.62 
 
 		 774 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  41.62 
 
 		 601 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  38.74 
 
 		 622 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  42.94 
 
 		 1587 aa  353  4e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  39.5 
 
 		 589 aa  352  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  41.18 
 
 		 576 aa  347  5e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  38.29 
 
 		 589 aa  345  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  39.2 
 
 		 1322 aa  341  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  36.45 
 
 		 575 aa  335  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  38.89 
 
 		 506 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  39.69 
 
 		 501 aa  289  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  34.82 
 
 		 599 aa  288  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  37.69 
 
 		 498 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  38.95 
 
 		 2182 aa  271  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  39.47 
 
 		 2701 aa  268  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  48.28 
 
 		 1175 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  35.38 
 
 		 2796 aa  248  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.89 
 
 		 1795 aa  221  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.43 
 
 		 3977 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  34.41 
 
 		 2852 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  25.29 
 
 		 423 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  23.01 
 
 		 776 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.63 
 
 		 1641 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 		 1641 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0580  alkaline phosphatase  45.56 
 
 		 748 aa  77  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00489448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  22.42 
 
 		 775 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  24.95 
 
 		 760 aa  75.1  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  23.54 
 
 		 723 aa  74.7  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  24.41 
 
 		 731 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  22.1 
 
 		 793 aa  72  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  24.01 
 
 		 733 aa  70.9  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  24.86 
 
 		 754 aa  70.5  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  25.14 
 
 		 754 aa  70.5  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  41.3 
 
 		 640 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  23.09 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  20.32 
 
 		 721 aa  68.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  24.38 
 
 		 732 aa  65.1  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  41.56 
 
 		 616 aa  65.1  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  24.92 
 
 		 732 aa  64.7  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  23.12 
 
 		 723 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  28.85 
 
 		 729 aa  60.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  28.37 
 
 		 729 aa  59.7  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  23.12 
 
 		 723 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  21.65 
 
 		 721 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  40 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  40 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  40 
 
 		 513 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.28 
 
 		 347 aa  56.2  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  41.67 
 
 		 513 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.25 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.57 
 
 		 348 aa  52  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.94 
 
 		 348 aa  51.2  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  21.78 
 
 		 719 aa  51.2  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.91 
 
 		 689 aa  49.3  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  29.05 
 
 		 810 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  39.06 
 
 		 556 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.16 
 
 		 338 aa  48.5  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.25 
 
 		 334 aa  47.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.25 
 
 		 327 aa  47  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.44 
 
 		 328 aa  45.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.48 
 
 		 335 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.77 
 
 		 328 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.35 
 
 		 354 aa  45.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.05 
 
 		 327 aa  44.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.22 
 
 		 328 aa  44.3  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>