105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4265 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  862    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  60.53 
 
 		 438 aa  501  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  39.57 
 
 		 472 aa  279  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  40.89 
 
 		 513 aa  266  8e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  40.65 
 
 		 513 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  40.89 
 
 		 513 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  40.89 
 
 		 513 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  40.71 
 
 		 461 aa  262  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  43.38 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  38.21 
 
 		 456 aa  249  8e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  33.58 
 
 		 998 aa  177  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  36.36 
 
 		 1844 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  30.77 
 
 		 438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  33.61 
 
 		 1175 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  31.4 
 
 		 454 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  30.94 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  30.14 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  30.23 
 
 		 451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  30.29 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  29.12 
 
 		 453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  28.05 
 
 		 510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  32.31 
 
 		 526 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  29.19 
 
 		 470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  30.63 
 
 		 699 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  36.88 
 
 		 469 aa  113  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  30.87 
 
 		 945 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  34.57 
 
 		 494 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  32.77 
 
 		 494 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  28.9 
 
 		 854 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  31.82 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  31.47 
 
 		 501 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  27.4 
 
 		 495 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  28.17 
 
 		 515 aa  97.8  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  28.97 
 
 		 491 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  31.21 
 
 		 504 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  36.17 
 
 		 466 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  27.09 
 
 		 495 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  27.48 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  25.93 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.11 
 
 		 3977 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  27.11 
 
 		 2852 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  29.12 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  29.12 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  29.74 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  26.3 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  24.8 
 
 		 490 aa  73.2  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  27.1 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  27.5 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  28.72 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  28.5 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  28.32 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.98 
 
 		 769 aa  69.7  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  22.04 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  26.33 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  22.04 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  28.35 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  26.92 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  25.81 
 
 		 451 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  28.96 
 
 		 464 aa  66.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  29.3 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  23.19 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  26.85 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  25 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  26.85 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  26.85 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  27.95 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.5 
 
 		 1016 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  23.74 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  26.46 
 
 		 458 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  23.87 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  26.15 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  26.26 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  24.06 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  26.18 
 
 		 729 aa  58.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  27.17 
 
 		 760 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  28.33 
 
 		 733 aa  57.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  24.62 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  27.61 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  27.24 
 
 		 719 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  26.77 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  26.45 
 
 		 729 aa  53.9  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  24.79 
 
 		 487 aa  53.1  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  29.53 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  27.98 
 
 		 732 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  27.98 
 
 		 732 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  25.83 
 
 		 379 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.01 
 
 		 657 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  24.55 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  27.27 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  25 
 
 		 720 aa  49.7  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  25.32 
 
 		 384 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  26.95 
 
 		 723 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  26.02 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  26.67 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  26.34 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  28.95 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  28.49 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.32 
 
 		 1027 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  24.22 
 
 		 731 aa  46.6  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  27.85 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>