77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1041 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  922    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  91.17 
 
 
453 aa  847    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  65.42 
 
 
454 aa  614  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  62.03 
 
 
457 aa  578  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  60.78 
 
 
451 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  59.48 
 
 
451 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  35 
 
 
699 aa  216  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  31.95 
 
 
526 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  33.52 
 
 
470 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  32.86 
 
 
438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  29.97 
 
 
998 aa  143  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  32.27 
 
 
512 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  29.12 
 
 
429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  30.37 
 
 
438 aa  128  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  29.86 
 
 
513 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  30.75 
 
 
1844 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  29.86 
 
 
513 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  30.41 
 
 
513 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  28.44 
 
 
461 aa  121  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  29.59 
 
 
513 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  30.54 
 
 
1175 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  29.52 
 
 
472 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  28.2 
 
 
456 aa  110  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  25.31 
 
 
510 aa  104  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  28.44 
 
 
2852 aa  81.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  30.16 
 
 
494 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  26.45 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  26.75 
 
 
945 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.11 
 
 
3977 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  27.89 
 
 
495 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  26.92 
 
 
495 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  26.25 
 
 
491 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  28.74 
 
 
504 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  26.25 
 
 
729 aa  60.1  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  25.82 
 
 
854 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  24.69 
 
 
469 aa  59.7  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  25.36 
 
 
457 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  25.36 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  36.07 
 
 
489 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.64 
 
 
1016 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  26.35 
 
 
415 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  24.64 
 
 
494 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  28.73 
 
 
733 aa  57.4  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  25.09 
 
 
501 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  25.42 
 
 
729 aa  53.9  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  24.1 
 
 
464 aa  53.9  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  25.31 
 
 
719 aa  53.9  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  25.17 
 
 
731 aa  53.5  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  24.73 
 
 
501 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  24.83 
 
 
451 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  23.66 
 
 
417 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  23.64 
 
 
515 aa  52.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  26.77 
 
 
487 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  26.98 
 
 
486 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  25.7 
 
 
466 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  27.39 
 
 
723 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  29.63 
 
 
454 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  27.16 
 
 
760 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25 
 
 
769 aa  50.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  23.64 
 
 
452 aa  50.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  26.82 
 
 
721 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  22.26 
 
 
441 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  25.55 
 
 
490 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  22.26 
 
 
379 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  21.98 
 
 
384 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  26.32 
 
 
754 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  24.87 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  21.91 
 
 
441 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  25.91 
 
 
754 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  24.27 
 
 
720 aa  45.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  24.89 
 
 
381 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  23.06 
 
 
454 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  23.92 
 
 
458 aa  44.3  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  26.89 
 
 
723 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  23.26 
 
 
448 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  27.61 
 
 
451 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.34 
 
 
1027 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>