71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1010 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  914    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  66.52 
 
 		 453 aa  629  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  65.42 
 
 		 453 aa  614  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  64.4 
 
 		 457 aa  595  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  62.44 
 
 		 451 aa  548  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  59.6 
 
 		 451 aa  546  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  34.94 
 
 		 699 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  31.19 
 
 		 526 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  34.23 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  31.38 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  31.4 
 
 		 429 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  31.7 
 
 		 438 aa  143  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  29.43 
 
 		 998 aa  136  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  30.48 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  32.75 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  30.64 
 
 		 513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  30.36 
 
 		 513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  30.64 
 
 		 513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  30.36 
 
 		 513 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  30.73 
 
 		 1844 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  26.92 
 
 		 510 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  29.79 
 
 		 472 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  31.25 
 
 		 1175 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  28.1 
 
 		 456 aa  116  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  28.42 
 
 		 495 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  26.32 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  29.55 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  29.59 
 
 		 494 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  27.63 
 
 		 2852 aa  78.2  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  28.08 
 
 		 495 aa  76.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.99 
 
 		 3977 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  25.32 
 
 		 945 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  24.19 
 
 		 415 aa  69.7  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  26.64 
 
 		 487 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  25 
 
 		 494 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  29.48 
 
 		 504 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  25.68 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  25.98 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  27.86 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  23.53 
 
 		 854 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  23.89 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  23.55 
 
 		 501 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  25.09 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25 
 
 		 769 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  24.16 
 
 		 486 aa  54.7  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  26.98 
 
 		 384 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  22.1 
 
 		 441 aa  54.3  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.34 
 
 		 1016 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  26.53 
 
 		 760 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  21.72 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  26.12 
 
 		 731 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  34.13 
 
 		 733 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  26.25 
 
 		 719 aa  51.2  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  23.36 
 
 		 464 aa  51.2  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  23.59 
 
 		 515 aa  50.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  23.72 
 
 		 452 aa  50.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  30.77 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  26.85 
 
 		 793 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  25 
 
 		 451 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  21.38 
 
 		 457 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  28.92 
 
 		 473 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  21.77 
 
 		 457 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  21.18 
 
 		 448 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  24.83 
 
 		 451 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.07 
 
 		 1372 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.29 
 
 		 1027 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  26.71 
 
 		 451 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  27.64 
 
 		 723 aa  45.8  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  26.23 
 
 		 729 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  23.86 
 
 		 451 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>