96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1211 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  100 
 
 
504 aa  1016    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  74.09 
 
 
494 aa  679    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  57.73 
 
 
469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  48.74 
 
 
466 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  34.39 
 
 
494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  35.55 
 
 
501 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  35.22 
 
 
501 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  26.91 
 
 
491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  27.1 
 
 
515 aa  110  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  33.58 
 
 
438 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  32.6 
 
 
512 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  31.21 
 
 
429 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  27.58 
 
 
495 aa  91.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  26.88 
 
 
854 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  33.96 
 
 
513 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  26.62 
 
 
495 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  36.27 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  33.96 
 
 
513 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  33.96 
 
 
513 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  33.49 
 
 
513 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  30.74 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  30.74 
 
 
457 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  27.92 
 
 
472 aa  80.1  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  27.61 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  26.06 
 
 
457 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  25.56 
 
 
451 aa  73.6  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  27.39 
 
 
461 aa  73.6  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  26.6 
 
 
470 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  30.35 
 
 
376 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  26.53 
 
 
486 aa  72  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.61 
 
 
657 aa  72.8  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  27.82 
 
 
490 aa  72  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  30.12 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  26.24 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  27.91 
 
 
453 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  27.74 
 
 
451 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  28.08 
 
 
489 aa  68.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  25.36 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  26.25 
 
 
453 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  29.26 
 
 
384 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  28.62 
 
 
438 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  29.48 
 
 
454 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  27.74 
 
 
448 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  30 
 
 
389 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  27.74 
 
 
448 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  28.47 
 
 
448 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  29.32 
 
 
381 aa  63.9  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  28.72 
 
 
1844 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  29.39 
 
 
448 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  24.13 
 
 
451 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  25.82 
 
 
454 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.98 
 
 
1016 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  29.63 
 
 
379 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  24 
 
 
458 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  29.63 
 
 
384 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  28.29 
 
 
344 aa  60.5  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  26.5 
 
 
473 aa  60.1  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  24.61 
 
 
452 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  24.03 
 
 
458 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  29.3 
 
 
399 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  25.7 
 
 
699 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  27.3 
 
 
419 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  25.68 
 
 
1175 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  28.37 
 
 
451 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  29.53 
 
 
354 aa  58.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  24.33 
 
 
441 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  27.57 
 
 
998 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  25.17 
 
 
451 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  24.33 
 
 
441 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  26.14 
 
 
464 aa  55.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  28.78 
 
 
410 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  28.78 
 
 
410 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  26.72 
 
 
452 aa  54.7  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  27.76 
 
 
404 aa  54.7  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  23.99 
 
 
451 aa  54.3  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  25.98 
 
 
396 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  28.9 
 
 
388 aa  54.3  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.37 
 
 
3977 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  28.5 
 
 
451 aa  53.9  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  27.17 
 
 
454 aa  53.9  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  27.02 
 
 
510 aa  53.5  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  27.35 
 
 
404 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  23.86 
 
 
417 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  29.57 
 
 
452 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  27.76 
 
 
390 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  28.25 
 
 
452 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  25.71 
 
 
526 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  27.81 
 
 
2852 aa  51.2  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  28.32 
 
 
401 aa  50.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  28.35 
 
 
348 aa  50.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  27.37 
 
 
452 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.92 
 
 
769 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  25.47 
 
 
945 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  26.89 
 
 
487 aa  48.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  26.22 
 
 
394 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  31.21 
 
 
390 aa  43.5  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>