63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2391 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  100 
 
 
510 aa  1048    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  37.7 
 
 
438 aa  274  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  34.29 
 
 
470 aa  220  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  29.45 
 
 
438 aa  143  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  32.5 
 
 
945 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  28.05 
 
 
429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  28.78 
 
 
461 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  28.82 
 
 
513 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  28.82 
 
 
513 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  28.6 
 
 
513 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  28.6 
 
 
513 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  27.12 
 
 
456 aa  121  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  26.92 
 
 
454 aa  120  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  26.46 
 
 
457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  29.73 
 
 
1844 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  29.05 
 
 
451 aa  115  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  27.09 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  27.44 
 
 
512 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  26.46 
 
 
472 aa  106  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  27.87 
 
 
451 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  25.31 
 
 
453 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  27.27 
 
 
998 aa  97.1  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  28.26 
 
 
1175 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  29.39 
 
 
494 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  26.27 
 
 
501 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  27.07 
 
 
501 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  29.62 
 
 
515 aa  76.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  27.24 
 
 
854 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  24.42 
 
 
699 aa  63.9  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  25.33 
 
 
495 aa  63.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  26.98 
 
 
2852 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  25.33 
 
 
495 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.81 
 
 
769 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.9 
 
 
1016 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  25.08 
 
 
489 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  26.32 
 
 
491 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  26.19 
 
 
494 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  23.83 
 
 
526 aa  54.3  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  26.95 
 
 
504 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  24.74 
 
 
469 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  26.92 
 
 
490 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  27.46 
 
 
454 aa  50.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  25.76 
 
 
452 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  26.45 
 
 
451 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  26.38 
 
 
451 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  27.27 
 
 
345 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  21.61 
 
 
415 aa  48.5  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  25.77 
 
 
451 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  35.29 
 
 
457 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  25.64 
 
 
486 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  25.88 
 
 
399 aa  46.6  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  23.03 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  35.29 
 
 
457 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  26.06 
 
 
452 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  24.76 
 
 
487 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  28.33 
 
 
451 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  28.39 
 
 
451 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  28.46 
 
 
458 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.28 
 
 
3977 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  27.05 
 
 
458 aa  43.5  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  28.7 
 
 
466 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  23.62 
 
 
390 aa  43.5  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  22.06 
 
 
389 aa  43.1  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>