58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0310 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  679    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  41.43 
 
 
389 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  37.15 
 
 
376 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  39.37 
 
 
381 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  35.76 
 
 
384 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  38.57 
 
 
404 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  38.29 
 
 
404 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  35.17 
 
 
379 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  34.94 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  35.49 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  37.22 
 
 
401 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  32.47 
 
 
396 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  31.91 
 
 
384 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  31.03 
 
 
394 aa  159  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  32.5 
 
 
419 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  33.06 
 
 
399 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.69 
 
 
1016 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  33.15 
 
 
410 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  33.15 
 
 
410 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  32.77 
 
 
387 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  31.44 
 
 
1844 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  31.94 
 
 
390 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  34.36 
 
 
344 aa  124  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  30.79 
 
 
383 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.52 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  29.13 
 
 
363 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  36.08 
 
 
504 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  35.42 
 
 
494 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0173  hypothetical protein  28.3 
 
 
306 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.854745  hitchhiker  0.0000000557216 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  31.45 
 
 
501 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  31.73 
 
 
501 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  33.33 
 
 
494 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  31.78 
 
 
469 aa  73.6  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.2 
 
 
657 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  26.42 
 
 
466 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  29.41 
 
 
470 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  27.95 
 
 
429 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  33.33 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  28.27 
 
 
451 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  25.12 
 
 
438 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  25.97 
 
 
451 aa  53.1  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  22.28 
 
 
441 aa  53.1  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  24.64 
 
 
513 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  27.19 
 
 
512 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  24.64 
 
 
513 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  24.15 
 
 
513 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  22.01 
 
 
441 aa  50.4  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4474  hypothetical protein  25.99 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  24.15 
 
 
513 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  27.27 
 
 
510 aa  48.5  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  26.8 
 
 
438 aa  47  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  30.4 
 
 
390 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  23.33 
 
 
472 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  24.87 
 
 
453 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  35.29 
 
 
490 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  24.57 
 
 
454 aa  42.7  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  30.97 
 
 
415 aa  43.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  23.15 
 
 
453 aa  42.4  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>