51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3774 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  755    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  64.33 
 
 
404 aa  411  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  63.76 
 
 
404 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  55.97 
 
 
381 aa  349  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  45.94 
 
 
401 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  41.43 
 
 
345 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  33.33 
 
 
376 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  34.97 
 
 
354 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  36.87 
 
 
388 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  35.49 
 
 
384 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  34.1 
 
 
399 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  35.6 
 
 
410 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  31.52 
 
 
396 aa  176  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  35.33 
 
 
410 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  35 
 
 
384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  34.37 
 
 
379 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  34.14 
 
 
419 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.6 
 
 
1016 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  30.23 
 
 
394 aa  159  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  31.43 
 
 
1844 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  29.37 
 
 
387 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  33.43 
 
 
390 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  26.39 
 
 
363 aa  125  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  32.58 
 
 
344 aa  119  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  30.77 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.03 
 
 
383 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.63 
 
 
657 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  28.01 
 
 
501 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  28.01 
 
 
501 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  30.5 
 
 
469 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  32.53 
 
 
348 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  26.54 
 
 
466 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  27.45 
 
 
494 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  29.01 
 
 
494 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  30 
 
 
504 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  29.3 
 
 
429 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0173  hypothetical protein  25.73 
 
 
306 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.854745  hitchhiker  0.0000000557216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  27.38 
 
 
438 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4474  hypothetical protein  26.79 
 
 
330 aa  53.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  27.17 
 
 
515 aa  49.7  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  25 
 
 
513 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  32.04 
 
 
358 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  25 
 
 
513 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  28.8 
 
 
470 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  33.98 
 
 
332 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  25 
 
 
513 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  24.65 
 
 
513 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  26.84 
 
 
512 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  34.02 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  22.06 
 
 
510 aa  43.9  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  34.95 
 
 
359 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.106647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>