59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1837 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  88.54 
 
 		 379 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  778    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  45.48 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  42.9 
 
 		 388 aa  245  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.6 
 
 		 1016 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  38.25 
 
 		 396 aa  223  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  40.29 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  40.33 
 
 		 1844 aa  210  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  36.67 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  37.36 
 
 		 410 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  37.36 
 
 		 410 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  33.63 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  33.61 
 
 		 399 aa  196  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  38.18 
 
 		 381 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  35.76 
 
 		 345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  34.6 
 
 		 390 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  35.49 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  34.1 
 
 		 376 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  35.24 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  34.38 
 
 		 404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  34.1 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  32.39 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.39 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  35.8 
 
 		 401 aa  146  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  29.66 
 
 		 344 aa  126  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  28.03 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  27.78 
 
 		 494 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  25.8 
 
 		 501 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  25.49 
 
 		 501 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  28.16 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  28.67 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  28.82 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  27.63 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  30.11 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  29.63 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.14 
 
 		 657 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  26.37 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  26.98 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2660  hypothetical protein  23.58 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0986775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  24.85 
 
 		 486 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  26.59 
 
 		 470 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  23.95 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  32.31 
 
 		 515 aa  50.8  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  26.2 
 
 		 438 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  25.54 
 
 		 466 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2664  hypothetical protein  22.22 
 
 		 308 aa  49.7  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4474  hypothetical protein  24 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  26.34 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  23.96 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  27.12 
 
 		 495 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  26.32 
 
 		 854 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  23.08 
 
 		 453 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  21.98 
 
 		 453 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  23.03 
 
 		 510 aa  46.2  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  27.18 
 
 		 495 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  26.75 
 
 		 490 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0173  hypothetical protein  27.37 
 
 		 306 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.854745  hitchhiker  0.0000000557216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  24.92 
 
 		 332 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  23.64 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>