55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1075 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  99.76 
 
 
410 aa  796    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  100 
 
 
410 aa  799    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  65.97 
 
 
419 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.76 
 
 
1016 aa  299  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  50 
 
 
396 aa  293  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  47.81 
 
 
1844 aa  272  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  45.71 
 
 
394 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  40.11 
 
 
399 aa  249  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  38.02 
 
 
376 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  37.36 
 
 
384 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  42.15 
 
 
390 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  38 
 
 
354 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  37.95 
 
 
387 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  36.24 
 
 
379 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  40.72 
 
 
384 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.38 
 
 
383 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  40.66 
 
 
383 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  37.47 
 
 
388 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  35.33 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  36.07 
 
 
381 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  33.7 
 
 
404 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  33.7 
 
 
404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  33.61 
 
 
345 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  34.15 
 
 
363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  31.71 
 
 
401 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  29.58 
 
 
344 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.37 
 
 
657 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  29.33 
 
 
501 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  29.39 
 
 
501 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  31.97 
 
 
494 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  26.77 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  28.38 
 
 
494 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  28.52 
 
 
469 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  30.63 
 
 
504 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  27.96 
 
 
348 aa  63.5  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  29.96 
 
 
429 aa  56.2  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  25.78 
 
 
486 aa  53.5  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  30.11 
 
 
438 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  28.01 
 
 
358 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  26.79 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  28.17 
 
 
491 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  24.49 
 
 
495 aa  46.6  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  26.06 
 
 
699 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  26.27 
 
 
384 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  26.69 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  30.22 
 
 
515 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  25.12 
 
 
513 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  25.12 
 
 
513 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  31.75 
 
 
490 aa  43.5  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  24.65 
 
 
457 aa  43.5  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  25.7 
 
 
470 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  26.74 
 
 
495 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  25.12 
 
 
513 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2288  hypothetical protein  25.08 
 
 
318 aa  42.7  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  24.65 
 
 
513 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>