54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0631 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  773    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  38.23 
 
 		 419 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  37.47 
 
 		 410 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  37.47 
 
 		 410 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  37.15 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  35.53 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  33.42 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  33.6 
 
 		 399 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.42 
 
 		 1016 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  34.55 
 
 		 404 aa  187  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  34.55 
 
 		 404 aa  186  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  34.4 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  34.1 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  31.52 
 
 		 379 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  31.37 
 
 		 354 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  33.07 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  34.45 
 
 		 394 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  34.77 
 
 		 1844 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  34.46 
 
 		 363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  32.77 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  31.14 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  32.87 
 
 		 390 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  31.04 
 
 		 383 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  29.66 
 
 		 387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.79 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  26.3 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  27.85 
 
 		 494 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  25.98 
 
 		 501 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  25.07 
 
 		 501 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  27.14 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  30.35 
 
 		 504 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.5 
 
 		 657 aa  67  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  26.8 
 
 		 470 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  24.58 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  26.77 
 
 		 429 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  27.72 
 
 		 438 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  24.44 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0173  hypothetical protein  23.12 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.854745  hitchhiker  0.0000000557216 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  23.29 
 
 		 441 aa  50.4  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  23.29 
 
 		 441 aa  50.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  24.09 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  24.74 
 
 		 486 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  23.32 
 
 		 466 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  31.16 
 
 		 491 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  23.81 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  28.79 
 
 		 515 aa  47.4  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  24.55 
 
 		 448 aa  47  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  24.55 
 
 		 448 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  24.26 
 
 		 451 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  24.65 
 
 		 512 aa  46.6  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  24.62 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  23.93 
 
 		 854 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  28.85 
 
 		 452 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  27.59 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>