45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1022 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  791    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  45.6 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  45.74 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  45.61 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  41.69 
 
 		 381 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  37.22 
 
 		 345 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  30.91 
 
 		 376 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  34.4 
 
 		 354 aa  152  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  35.47 
 
 		 384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  34.08 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.67 
 
 		 1016 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  26.49 
 
 		 394 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  30.31 
 
 		 396 aa  132  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  32.02 
 
 		 384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  31.93 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  32.4 
 
 		 390 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  29.83 
 
 		 1844 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  27.41 
 
 		 383 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.41 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  30.28 
 
 		 410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  30.53 
 
 		 410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  25.19 
 
 		 363 aa  112  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  28.07 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  31.99 
 
 		 344 aa  111  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  27.42 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  26.72 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  29.24 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  29.35 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  24.03 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.93 
 
 		 657 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  28.3 
 
 		 494 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  28.32 
 
 		 504 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0173  hypothetical protein  28 
 
 		 306 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.854745  hitchhiker  0.0000000557216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  27.32 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  26.97 
 
 		 470 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  27.22 
 
 		 358 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  27.64 
 
 		 469 aa  47  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  27.85 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  27.11 
 
 		 723 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  28.19 
 
 		 359 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  31.3 
 
 		 945 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  31.82 
 
 		 461 aa  43.9  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  24.26 
 
 		 491 aa  43.5  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  25.91 
 
 		 512 aa  43.5  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  26.82 
 
 		 438 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>