77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4876 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  935    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  64.4 
 
 		 454 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  62.69 
 
 		 453 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  62.03 
 
 		 453 aa  578  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  58.04 
 
 		 451 aa  511  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  56.65 
 
 		 451 aa  504  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  34.68 
 
 		 699 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3681  hypothetical protein  31.52 
 
 		 526 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12875  normal  0.0308963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  34.46 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  32.94 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  32.07 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  30.14 
 
 		 429 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  32.06 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  30.57 
 
 		 461 aa  133  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  31.52 
 
 		 513 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  31.52 
 
 		 513 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  28.11 
 
 		 998 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  31.42 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  30.98 
 
 		 513 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  28.64 
 
 		 472 aa  123  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2363  hypothetical protein  27.21 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  26.46 
 
 		 510 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  29.76 
 
 		 1844 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  28.95 
 
 		 1175 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.02 
 
 		 3977 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  28.23 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  27.96 
 
 		 2852 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  27.87 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  31.44 
 
 		 469 aa  69.7  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  26.32 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  26.38 
 
 		 945 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  27.21 
 
 		 495 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  33.59 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  26.82 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  25.93 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  25.27 
 
 		 494 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  29.17 
 
 		 731 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  25.97 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  24.92 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  27.3 
 
 		 501 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  26.96 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  25.18 
 
 		 854 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 		 1016 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  26.37 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  25.93 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  29.27 
 
 		 733 aa  54.3  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  23.84 
 
 		 769 aa  53.9  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2270  hypothetical protein  25.53 
 
 		 486 aa  50.8  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  30.66 
 
 		 729 aa  50.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  27.95 
 
 		 451 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  27.33 
 
 		 451 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  23.32 
 
 		 473 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2577  hypothetical protein  29.55 
 
 		 515 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  29.61 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  24.81 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  24.81 
 
 		 457 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  23.7 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1485  hypothetical protein  26.02 
 
 		 490 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  26.91 
 
 		 723 aa  47  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  25.2 
 
 		 760 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  25.49 
 
 		 451 aa  47  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  35.96 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  26.45 
 
 		 754 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  26.02 
 
 		 719 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  24.53 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  26.25 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  28.66 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  26.35 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  26.38 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  29.2 
 
 		 729 aa  45.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  27.69 
 
 		 776 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  28.29 
 
 		 448 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  28.29 
 
 		 448 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  28.29 
 
 		 448 aa  43.9  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  27.78 
 
 		 454 aa  43.5  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  28.66 
 
 		 448 aa  43.1  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  25.11 
 
 		 720 aa  43.5  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>