49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5061 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  751    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  55.31 
 
 		 389 aa  351  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  54.7 
 
 		 404 aa  317  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  54.42 
 
 		 404 aa  315  6e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  41.69 
 
 		 401 aa  230  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  35.53 
 
 		 376 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  39.54 
 
 		 345 aa  199  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  36.22 
 
 		 354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  38.18 
 
 		 384 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  37.64 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  32.5 
 
 		 396 aa  187  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  31.25 
 
 		 399 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  32.05 
 
 		 419 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  36.34 
 
 		 410 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.87 
 
 		 1016 aa  169  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  31.03 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  36.07 
 
 		 410 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  33.97 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  35.11 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  32.16 
 
 		 1844 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  33.9 
 
 		 390 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  27.79 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  32.69 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.69 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  35.17 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  31.53 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.36 
 
 		 657 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  26.89 
 
 		 494 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  32.55 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  26.64 
 
 		 501 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  26.64 
 
 		 501 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  30.69 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  28.24 
 
 		 494 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  26.76 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  29.32 
 
 		 504 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  27.47 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4474  hypothetical protein  27.25 
 
 		 330 aa  53.9  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  28.69 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  27.27 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  27.95 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  25.82 
 
 		 438 aa  50.4  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  27.73 
 
 		 495 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  26.72 
 
 		 495 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2092  outer membrane autotransporter  29.41 
 
 		 854 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.142102  normal  0.0191912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  31.21 
 
 		 438 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1041  hypothetical protein  24.89 
 
 		 453 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  27.68 
 
 		 451 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  26.09 
 
 		 358 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2173  hypothetical protein  27.2 
 
 		 491 aa  42.7  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.688585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>