58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4785 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  78.94 
 
 		 451 aa  757    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  100 
 
 		 451 aa  920    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  83.81 
 
 		 452 aa  765    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  82.26 
 
 		 451 aa  780    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  84.04 
 
 		 451 aa  769    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  68.71 
 
 		 452 aa  615  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  64.67 
 
 		 451 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  66.97 
 
 		 448 aa  608  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  65.16 
 
 		 454 aa  587  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  62.93 
 
 		 448 aa  561  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  61.16 
 
 		 448 aa  560  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  61.16 
 
 		 448 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  60.94 
 
 		 448 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  62.2 
 
 		 458 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  61.96 
 
 		 458 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  57.49 
 
 		 452 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  55.73 
 
 		 452 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  57.47 
 
 		 473 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  56.04 
 
 		 452 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  53.3 
 
 		 454 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  55.43 
 
 		 464 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  49.34 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  50 
 
 		 441 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  44.1 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  38.56 
 
 		 415 aa  232  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  33.96 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  33.96 
 
 		 457 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  35.7 
 
 		 390 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  34.17 
 
 		 417 aa  209  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.94 
 
 		 769 aa  184  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4473  putative signal peptide protein  48.26 
 
 		 208 aa  167  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  29.77 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.86 
 
 		 1027 aa  116  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.78 
 
 		 1372 aa  113  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  31.66 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  28.72 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  27.5 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  27.07 
 
 		 501 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  28.83 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  23.6 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  29.05 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  28.5 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49693  predicted protein  25.37 
 
 		 525 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  25.96 
 
 		 470 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  27.56 
 
 		 494 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  25.13 
 
 		 513 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  25.89 
 
 		 513 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2391  hypothetical protein  26.45 
 
 		 510 aa  49.7  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  25.89 
 
 		 513 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  24.87 
 
 		 513 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  26.76 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  25.48 
 
 		 1844 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0807  hypothetical protein  26.06 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03023  conserved hypothetical protein  25.93 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386636 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  26.25 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4033  hypothetical protein  24.86 
 
 		 512 aa  45.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104579  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  24.26 
 
 		 466 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  23.86 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>