24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0467 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0467  hypothetical protein  100 
 
 		 655 aa  1332    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0444  hypothetical protein  38.45 
 
 		 615 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.965283  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0108  hypothetical protein  42.96 
 
 		 309 aa  108  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0063  hypothetical protein  26.91 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000187215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.37 
 
 		 11716 aa  76.6  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2650  hypothetical protein  31.76 
 
 		 496 aa  69.7  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0126037  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1578  hypothetical protein  30.15 
 
 		 467 aa  60.1  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  37.8 
 
 		 699 aa  60.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  33.33 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3314  hypothetical protein  34.43 
 
 		 330 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.82 
 
 		 522 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.82 
 
 		 521 aa  56.2  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  31.78 
 
 		 446 aa  55.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00505  hypothetical protein  32.24 
 
 		 511 aa  53.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2089  hypothetical protein  40 
 
 		 850 aa  51.6  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3650  putative lipoprotein transmembrane  32.8 
 
 		 119 aa  51.6  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2452  hypothetical protein  33.67 
 
 		 539 aa  50.8  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0816235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0764  hypothetical protein  39.08 
 
 		 769 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3038  hypothetical protein  37.63 
 
 		 570 aa  48.9  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001966  chromosome segregation ATPase  29.94 
 
 		 490 aa  48.5  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.26 
 
 		 818 aa  46.2  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.43 
 
 		 821 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3327  putative lipoprotein transmembrane  32.71 
 
 		 119 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1066  hypothetical protein  34.19 
 
 		 912 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>