12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2452 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2452  hypothetical protein  100 
 
 		 539 aa  1099    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0816235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01294  hypothetical protein  25.56 
 
 		 413 aa  99.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.341025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1181  hypothetical protein  22.99 
 
 		 401 aa  90.1  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.497989  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2089  hypothetical protein  31.16 
 
 		 850 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645532  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  31.11 
 
 		 446 aa  54.7  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0467  hypothetical protein  34.04 
 
 		 655 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  26.09 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0764  hypothetical protein  31.76 
 
 		 769 aa  47  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0101  putative lipoprotein transmembrane  30.34 
 
 		 120 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.760048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.18 
 
 		 521 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.56 
 
 		 522 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.36 
 
 		 818 aa  43.5  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>