287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0025 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  97.51 
 
 		 521 aa  853    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  100 
 
 		 522 aa  983    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  56.52 
 
 		 480 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  54.31 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2089  hypothetical protein  36.19 
 
 		 850 aa  191  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645532  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  32.84 
 
 		 332 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  34.95 
 
 		 1094 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  32.77 
 
 		 580 aa  106  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  27.42 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  27.06 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  35.02 
 
 		 354 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.09 
 
 		 689 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  26.5 
 
 		 414 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  26.51 
 
 		 350 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  32.61 
 
 		 353 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.02 
 
 		 366 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.48 
 
 		 354 aa  98.2  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  25.54 
 
 		 410 aa  97.1  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  33.22 
 
 		 391 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  32.25 
 
 		 335 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  25.08 
 
 		 349 aa  93.6  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  27.85 
 
 		 412 aa  91.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  27.53 
 
 		 776 aa  90.9  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  24.72 
 
 		 386 aa  90.1  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  33.22 
 
 		 387 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  27.43 
 
 		 355 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  23.16 
 
 		 368 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.42 
 
 		 353 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  27.19 
 
 		 355 aa  87.4  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.68 
 
 		 354 aa  87  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.45 
 
 		 1170 aa  87  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  26.12 
 
 		 367 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  27.14 
 
 		 355 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  27.7 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  25.3 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  23.13 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  26.09 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  27.73 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  26.64 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  33.62 
 
 		 1667 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  27.02 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  25.63 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  23.7 
 
 		 404 aa  83.2  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  24.92 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  25.94 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  33.71 
 
 		 971 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  23.79 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  31.53 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  23.08 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  23.8 
 
 		 359 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  27.27 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  32.52 
 
 		 1189 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  22.46 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  26.5 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  27.57 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  26.02 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  26.02 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0259  putative 3-carboxymuconate cyclase  28.73 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  26.39 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  26.79 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  36.13 
 
 		 272 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  22.32 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  25.26 
 
 		 370 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  24.13 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  32.34 
 
 		 810 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  24.13 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  25.15 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  22.32 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.5 
 
 		 752 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  23.68 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  26.61 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  24.13 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  24.13 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  24.13 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  27.04 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  24.13 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  25.42 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  22.4 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  22.92 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  23.84 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  24.2 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  24.46 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  26.14 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  23.22 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  26.81 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0101  putative lipoprotein transmembrane  46.43 
 
 		 120 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.760048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0764  hypothetical protein  51.85 
 
 		 769 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  23.55 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.84 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  23.87 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6529  6-phosphogluconolactonase  24.29 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111343  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  23.87 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  23.87 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  23.97 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  24.21 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  23.81 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.13 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.39 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.41 
 
 		 415 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  26.82 
 
 		 379 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>