139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2089 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2089  hypothetical protein  100 
 
 		 850 aa  1635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645532  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  36.74 
 
 		 480 aa  197  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.12 
 
 		 522 aa  195  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.05 
 
 		 521 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  35.04 
 
 		 446 aa  181  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0764  hypothetical protein  42.86 
 
 		 769 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3038  hypothetical protein  45.76 
 
 		 570 aa  117  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  24.91 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1066  hypothetical protein  35.8 
 
 		 912 aa  79.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  33.5 
 
 		 414 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  30.73 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  25.61 
 
 		 353 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  31.19 
 
 		 1094 aa  71.6  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  27.42 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0101  putative lipoprotein transmembrane  49.38 
 
 		 120 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.760048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3650  putative lipoprotein transmembrane  48.75 
 
 		 119 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3327  putative lipoprotein transmembrane  47.5 
 
 		 119 aa  68.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  24.58 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  27.49 
 
 		 414 aa  67  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  28.17 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  27.27 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  29.76 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  26.32 
 
 		 415 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  26.32 
 
 		 415 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  26.32 
 
 		 355 aa  63.9  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  26.32 
 
 		 415 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  30.5 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  29.69 
 
 		 335 aa  63.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  31.43 
 
 		 355 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  32.04 
 
 		 387 aa  62  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  31.21 
 
 		 354 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  29.78 
 
 		 810 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  23.53 
 
 		 386 aa  60.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  25.08 
 
 		 351 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  29.29 
 
 		 355 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  30.5 
 
 		 354 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  26.41 
 
 		 348 aa  59.7  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  26.32 
 
 		 415 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.8 
 
 		 354 aa  59.7  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  29.79 
 
 		 355 aa  59.7  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  25.45 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  24.76 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  23.02 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  26.02 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  35.35 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.72 
 
 		 1170 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2452  hypothetical protein  31.16 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0816235  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  29.08 
 
 		 355 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  25.6 
 
 		 368 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  29.08 
 
 		 353 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  25.98 
 
 		 351 aa  57.4  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  27.5 
 
 		 363 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  25.35 
 
 		 363 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  25.79 
 
 		 363 aa  57  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  26.09 
 
 		 359 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  27.19 
 
 		 377 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  25.47 
 
 		 431 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  33.33 
 
 		 580 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.03 
 
 		 821 aa  55.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.37 
 
 		 818 aa  55.5  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  25.77 
 
 		 380 aa  54.7  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  22.71 
 
 		 386 aa  54.3  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  27.24 
 
 		 332 aa  53.9  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  25.16 
 
 		 375 aa  54.3  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  25.16 
 
 		 363 aa  53.9  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.97 
 
 		 366 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  47.37 
 
 		 688 aa  53.9  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  26.55 
 
 		 385 aa  53.5  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  24.53 
 
 		 332 aa  53.5  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  36.31 
 
 		 354 aa  53.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  25.64 
 
 		 329 aa  52.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  26.67 
 
 		 379 aa  52.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.82 
 
 		 311 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  24.39 
 
 		 369 aa  52  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  29.22 
 
 		 391 aa  52  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  21.21 
 
 		 418 aa  51.6  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  23.08 
 
 		 334 aa  51.6  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  22.46 
 
 		 376 aa  51.6  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0467  hypothetical protein  40 
 
 		 655 aa  51.6  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  25.27 
 
 		 404 aa  51.2  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  23.08 
 
 		 334 aa  51.6  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  24.41 
 
 		 345 aa  51.6  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.4 
 
 		 2114 aa  51.2  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.57 
 
 		 311 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  28.47 
 
 		 376 aa  51.2  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6529  6-phosphogluconolactonase  23.88 
 
 		 359 aa  51.2  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111343  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  23.89 
 
 		 411 aa  50.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  23.8 
 
 		 411 aa  50.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  23.81 
 
 		 391 aa  50.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  23.89 
 
 		 411 aa  50.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  23.81 
 
 		 391 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  23.81 
 
 		 391 aa  50.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  24.05 
 
 		 332 aa  50.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  25.72 
 
 		 414 aa  50.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  33.73 
 
 		 1014 aa  50.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1667 aa  50.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  23.61 
 
 		 411 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  23.61 
 
 		 411 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.35 
 
 		 575 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  23.28 
 
 		 363 aa  49.3  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>