18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3650 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3650  putative lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 119 aa  231  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3327  putative lipoprotein transmembrane  94.96 
 
 		 119 aa  220  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0101  putative lipoprotein transmembrane  58.47 
 
 		 120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.760048  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  45.78 
 
 		 446 aa  72  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2089  hypothetical protein  48.75 
 
 		 850 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  38 
 
 		 818 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  43.37 
 
 		 522 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  43.37 
 
 		 521 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  42.17 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.48 
 
 		 821 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3038  hypothetical protein  43.02 
 
 		 570 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0764  hypothetical protein  43.75 
 
 		 769 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0467  hypothetical protein  32.8 
 
 		 655 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1066  hypothetical protein  35.29 
 
 		 912 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  30.68 
 
 		 1014 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  45.9 
 
 		 688 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2452  hypothetical protein  29.21 
 
 		 539 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0816235  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0444  hypothetical protein  28.57 
 
 		 615 aa  40.4  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.965283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>