18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0444 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0444  hypothetical protein  100 
 
 		 615 aa  1240    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.965283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0467  hypothetical protein  38.6 
 
 		 655 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0108  hypothetical protein  32.34 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.9 
 
 		 11716 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2650  hypothetical protein  33.33 
 
 		 496 aa  69.7  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0126037  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3314  hypothetical protein  33.91 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075687 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1578  hypothetical protein  32.61 
 
 		 467 aa  60.1  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0063  hypothetical protein  23.8 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000187215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2228  hypothetical protein  33.54 
 
 		 699 aa  59.3  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374706  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00505  hypothetical protein  28.57 
 
 		 511 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  27.83 
 
 		 480 aa  48.5  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0764  hypothetical protein  36.59 
 
 		 769 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2844  hypothetical protein  33.98 
 
 		 652 aa  47.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0262181  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001966  chromosome segregation ATPase  25.62 
 
 		 490 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2089  hypothetical protein  26.62 
 
 		 850 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.25 
 
 		 522 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.25 
 
 		 521 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  30.77 
 
 		 446 aa  44.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>