16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3327 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3327  putative lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 119 aa  232  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3650  putative lipoprotein transmembrane  94.96 
 
 		 119 aa  220  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0101  putative lipoprotein transmembrane  57.14 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.760048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2089  hypothetical protein  47.5 
 
 		 850 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  42.17 
 
 		 521 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  42.17 
 
 		 522 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  42.17 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.73 
 
 		 818 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  39.76 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.02 
 
 		 821 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3038  hypothetical protein  41.86 
 
 		 570 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0764  hypothetical protein  42.5 
 
 		 769 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0467  hypothetical protein  32.71 
 
 		 655 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 912 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 688 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2452  hypothetical protein  26.23 
 
 		 539 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0816235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>