268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01887 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  100 
 
 		 446 aa  847    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  60.49 
 
 		 480 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  54.81 
 
 		 521 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  49.79 
 
 		 522 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2089  hypothetical protein  34.06 
 
 		 850 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  28 
 
 		 367 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  36.75 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  27.03 
 
 		 375 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  27.03 
 
 		 363 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  27.64 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  28.36 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  27.32 
 
 		 410 aa  97.8  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  25.95 
 
 		 353 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 		 354 aa  96.7  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  27.96 
 
 		 351 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  25.88 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  31.94 
 
 		 1094 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  25.58 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  25 
 
 		 363 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  30.34 
 
 		 335 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.44 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.01 
 
 		 354 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  29.17 
 
 		 332 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  29.88 
 
 		 580 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  30.9 
 
 		 1667 aa  91.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  25.14 
 
 		 363 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1170 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.55 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  28.32 
 
 		 350 aa  87.4  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  26.59 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  28.95 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  27.55 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  24.32 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  25.22 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  26.22 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  29 
 
 		 351 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  29.03 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  29 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  30.13 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  28.62 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  28.85 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6529  6-phosphogluconolactonase  25.07 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111343  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  29.61 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.77 
 
 		 689 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  24.6 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  28.62 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  28.62 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  28.62 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  24.75 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.15 
 
 		 752 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  27.27 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  26.02 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  25.23 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  26.71 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  24.45 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  30.77 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  24.44 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  26.86 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  27.87 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  27.87 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  28.22 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  28.22 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  27.92 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.05 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  27.87 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  27.87 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.87 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  23.9 
 
 		 329 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  28.01 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  28.25 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3650  putative lipoprotein transmembrane  45.78 
 
 		 119 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.16 
 
 		 320 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  26.15 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  26.14 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  20.54 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  23.5 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  27.24 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  22.83 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  30.63 
 
 		 971 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  25.43 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.08 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  23.77 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2566  hypothetical protein  24.52 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  27.69 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  23.79 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1189 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  20 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  30.38 
 
 		 819 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  21.24 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0101  putative lipoprotein transmembrane  44.58 
 
 		 120 aa  67  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.760048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  25.36 
 
 		 377 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.71 
 
 		 652 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  23.89 
 
 		 334 aa  67  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  23.89 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  21.24 
 
 		 354 aa  67  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3327  putative lipoprotein transmembrane  42.17 
 
 		 119 aa  67  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  20 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  24.7 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  20 
 
 		 355 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  28.19 
 
 		 810 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>