280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0020 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  97.51 
 
 		 522 aa  854    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  100 
 
 		 521 aa  979    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  56.13 
 
 		 480 aa  477  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  55.02 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2089  hypothetical protein  35.41 
 
 		 850 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645532  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  32.24 
 
 		 332 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  27.42 
 
 		 373 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  32.77 
 
 		 580 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  27.39 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.09 
 
 		 689 aa  103  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  34.42 
 
 		 1094 aa  103  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.74 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  26.51 
 
 		 350 aa  101  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  32.97 
 
 		 353 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  27.95 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  26.63 
 
 		 414 aa  97.8  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  25.3 
 
 		 349 aa  96.3  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.63 
 
 		 366 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  27.99 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  33.22 
 
 		 391 aa  94.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  26.55 
 
 		 367 aa  94.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.75 
 
 		 354 aa  94.7  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  37.77 
 
 		 335 aa  94  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  27.87 
 
 		 776 aa  92  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  24.72 
 
 		 386 aa  91.3  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.93 
 
 		 353 aa  90.1  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  28.32 
 
 		 355 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  27.27 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  22.97 
 
 		 348 aa  87.8  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  26.09 
 
 		 351 aa  87.8  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.14 
 
 		 354 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  27.43 
 
 		 355 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  23.16 
 
 		 368 aa  87.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  32.81 
 
 		 387 aa  87  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  32.54 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  25.91 
 
 		 380 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  27.14 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  25.3 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  26.9 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  23.69 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  23.08 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  26.71 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  24.5 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  33.6 
 
 		 1667 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  24.3 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  27.55 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  26.48 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  23.47 
 
 		 353 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  26.32 
 
 		 355 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  26.32 
 
 		 353 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  22.19 
 
 		 375 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  23.38 
 
 		 404 aa  79.7  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  22.19 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  26.39 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0259  putative 3-carboxymuconate cyclase  29.2 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  34.22 
 
 		 971 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  24.28 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  27.86 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  27.03 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  26.5 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  24.93 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  25.25 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  25.58 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  22.92 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  27.18 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  24.42 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  27.38 
 
 		 355 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  27.17 
 
 		 353 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  24.42 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  24.42 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  25.88 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.82 
 
 		 752 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6529  6-phosphogluconolactonase  24.86 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111343  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  24.42 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  24.42 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  24.42 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  27.51 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  32.02 
 
 		 1189 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  25 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  26.95 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  24.09 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  24.77 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  24.13 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  23.69 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  23.69 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  23.69 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0764  hypothetical protein  51.85 
 
 		 769 aa  73.6  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  23.81 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0101  putative lipoprotein transmembrane  46.43 
 
 		 120 aa  73.6  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.760048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  25.15 
 
 		 384 aa  73.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  32.34 
 
 		 810 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  31.01 
 
 		 819 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.93 
 
 		 272 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  23.97 
 
 		 372 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  23.84 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  24.67 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  26.97 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.5 
 
 		 365 aa  72  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  24.69 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.32 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>