98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0259 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0259  putative 3-carboxymuconate cyclase  100 
 
 		 375 aa  743    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1686  hypothetical protein  38.74 
 
 		 359 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0479604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2811  hypothetical protein  37.87 
 
 		 369 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1703  hypothetical protein  35.74 
 
 		 357 aa  182  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1704  hypothetical protein  36.31 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6277  hypothetical protein  35.07 
 
 		 382 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5379  putative 3-carboxymuconate cyclase  36.75 
 
 		 364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4891  hypothetical protein  29.41 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.2 
 
 		 521 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  27.36 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.73 
 
 		 522 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  29.18 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  28.53 
 
 		 410 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  24.75 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  24.1 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  28.16 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  26.41 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  23.3 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  24.72 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  25.7 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  22.96 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  21.33 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  24.72 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  24.21 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  26.97 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1746  3-carboxymuconate cyclase-like protein  26.14 
 
 		 328 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00917254  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  22.92 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.99 
 
 		 1170 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  23.17 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  25.34 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  26 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  26.27 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  25.21 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  22.56 
 
 		 348 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  23.12 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  25.11 
 
 		 380 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2878  6-phosphogluconolactonase  25.23 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  29.29 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  27.55 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.85 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  26.51 
 
 		 329 aa  54.3  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  25.49 
 
 		 376 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  25.49 
 
 		 380 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  24.56 
 
 		 359 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  26.35 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6529  6-phosphogluconolactonase  22.26 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111343  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  27.32 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  27.23 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  26.46 
 
 		 404 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  25.99 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.52 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  32.05 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  25.16 
 
 		 412 aa  50.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  22.84 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.47 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.47 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.47 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06344  6-phosphogluconolactonase  22.99 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2199  6-phosphogluconolactonase  22.47 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  27.86 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.38 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5895  3-carboxymuconate cyclase-like  23.25 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2182  3-carboxymuconate cyclase-like protein  23.25 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  23.66 
 
 		 431 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  36.08 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2784  hypothetical protein  22.95 
 
 		 436 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  36.08 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  36.08 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.1 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.82 
 
 		 348 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  26.74 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  22.79 
 
 		 342 aa  47  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  23.43 
 
 		 372 aa  46.6  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  23.13 
 
 		 480 aa  46.6  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  24.91 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  37.93 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5499  3-carboxymuconate cyclase-like  25.34 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  28.12 
 
 		 3222 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.18 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  24.83 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  26.47 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  26.67 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0647  Domain of unknown function DUF2394  23.9 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0296594  hitchhiker  0.00133017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  23.58 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.09 
 
 		 383 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  26.42 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.56 
 
 		 320 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.64 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  31.34 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.48 
 
 		 318 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.83 
 
 		 314 aa  43.5  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2011  hypothetical protein  23.78 
 
 		 342 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1978  hypothetical protein  23.78 
 
 		 342 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2566  hypothetical protein  23.3 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  33.33 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.57 
 
 		 607 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.41 
 
 		 406 aa  42.7  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>