183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4552 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  100 
 
 
369 aa  745    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  56.04 
 
 
351 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  53.3 
 
 
350 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  53.13 
 
 
414 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  55.22 
 
 
410 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  47.41 
 
 
354 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2566  hypothetical protein  37.97 
 
 
332 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  36.26 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  37.07 
 
 
350 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  30.4 
 
 
353 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  30.38 
 
 
376 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  32.7 
 
 
373 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  33.42 
 
 
404 aa  169  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  35.23 
 
 
418 aa  164  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  33.97 
 
 
349 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  27.81 
 
 
354 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  32.94 
 
 
372 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  27.27 
 
 
354 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  28.27 
 
 
355 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  28.27 
 
 
355 aa  159  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  31.15 
 
 
370 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  27.32 
 
 
355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  34.07 
 
 
363 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  27.3 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  33.13 
 
 
385 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  27.03 
 
 
354 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  26.93 
 
 
355 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  31.53 
 
 
381 aa  150  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  33.25 
 
 
412 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  29.27 
 
 
368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  26.93 
 
 
355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  30.71 
 
 
412 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  27.32 
 
 
355 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  27.03 
 
 
353 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  34.96 
 
 
351 aa  146  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  32.64 
 
 
412 aa  146  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  32.88 
 
 
345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  32.15 
 
 
411 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  32.15 
 
 
391 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  32.15 
 
 
411 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  32.15 
 
 
391 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  32.15 
 
 
411 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  32.15 
 
 
385 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  31.5 
 
 
414 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  31.56 
 
 
431 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  32.15 
 
 
411 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  31.86 
 
 
391 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  32.84 
 
 
414 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  31.96 
 
 
414 aa  143  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  32.34 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  32.34 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32.34 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  31.56 
 
 
411 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  27.79 
 
 
352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  32.05 
 
 
415 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  31.46 
 
 
348 aa  133  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  30.95 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  24.5 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  27.4 
 
 
372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  33.43 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  31.11 
 
 
391 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  28.97 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  27.54 
 
 
394 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  36.29 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  29.23 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  28.45 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  32.35 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  29.29 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  26.95 
 
 
390 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  35.14 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  25.61 
 
 
339 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  31.38 
 
 
376 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  30.51 
 
 
342 aa  109  9.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  25.14 
 
 
339 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  23.77 
 
 
338 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  29.28 
 
 
363 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  31.55 
 
 
352 aa  103  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.799827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  32.07 
 
 
376 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  30.86 
 
 
367 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  26.17 
 
 
384 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  32.07 
 
 
380 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1978  hypothetical protein  32.31 
 
 
342 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2011  hypothetical protein  32.31 
 
 
342 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  34.46 
 
 
379 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  31.34 
 
 
353 aa  97.1  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  27.99 
 
 
334 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  27.99 
 
 
334 aa  96.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2650  3-carboxymuconate cyclase  29.91 
 
 
328 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  35.09 
 
 
331 aa  94  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  25.96 
 
 
338 aa  93.2  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  34.5 
 
 
331 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  34.5 
 
 
331 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  34.5 
 
 
331 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  34.5 
 
 
331 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  26.44 
 
 
342 aa  92  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
331 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  34.5 
 
 
331 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  29.86 
 
 
363 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  34.5 
 
 
331 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>