163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0790 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  99.7 
 
 
331 aa  686    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  98.79 
 
 
331 aa  679    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  91.24 
 
 
331 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  91.24 
 
 
331 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  99.7 
 
 
331 aa  686    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  99.7 
 
 
331 aa  686    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  91.24 
 
 
331 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  99.09 
 
 
331 aa  683    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  91.24 
 
 
331 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  99.7 
 
 
331 aa  686    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
331 aa  687    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  91.24 
 
 
331 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  86.1 
 
 
331 aa  609  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  61.63 
 
 
332 aa  421  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  61.63 
 
 
332 aa  418  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  61.63 
 
 
329 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2878  6-phosphogluconolactonase  61.33 
 
 
331 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  57.4 
 
 
331 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  56.84 
 
 
334 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  56.53 
 
 
334 aa  381  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0244  6-phosphogluconolactonase  45.15 
 
 
333 aa  322  6e-87  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  36.89 
 
 
363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  35.56 
 
 
375 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  35.56 
 
 
363 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  34.87 
 
 
386 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  35.26 
 
 
363 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  36.14 
 
 
363 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  33.94 
 
 
367 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  33.62 
 
 
386 aa  186  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  34.49 
 
 
380 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5499  3-carboxymuconate cyclase-like  30.97 
 
 
349 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2221  3-carboxymuconate cyclase-like protein  30.68 
 
 
349 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5895  3-carboxymuconate cyclase-like  30.26 
 
 
349 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2182  3-carboxymuconate cyclase-like protein  30.26 
 
 
349 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2099  6-phosphogluconolactonase  30.68 
 
 
349 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  29.77 
 
 
359 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  28.61 
 
 
377 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  31.27 
 
 
373 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2199  6-phosphogluconolactonase  30.55 
 
 
348 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6529  6-phosphogluconolactonase  31.83 
 
 
359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111343  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1090  6-phosphogluconolactonase  29.71 
 
 
348 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  29.51 
 
 
368 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  31.72 
 
 
376 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  29.55 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  30.9 
 
 
350 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  28.29 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  25.53 
 
 
353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  30.15 
 
 
355 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  30.77 
 
 
355 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  30.11 
 
 
342 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  28.76 
 
 
350 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  30.25 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  29.85 
 
 
355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  29.85 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  29.6 
 
 
351 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  27.49 
 
 
372 aa  119  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1974  6-phosphogluconolactonase  25.81 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.290723  normal  0.0128629 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  27.33 
 
 
354 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  28.66 
 
 
349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  30.25 
 
 
354 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  32.64 
 
 
338 aa  116  5e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  28.79 
 
 
372 aa  116  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  28.42 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  31.14 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  27.05 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  32.5 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  32.96 
 
 
411 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  32 
 
 
414 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  32.96 
 
 
411 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  32.58 
 
 
411 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  32.58 
 
 
411 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  32.58 
 
 
391 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  29.32 
 
 
355 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  26.89 
 
 
414 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  32.58 
 
 
391 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  32.58 
 
 
391 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  29.32 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  28.52 
 
 
348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  29.08 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  32.73 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32.73 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32.73 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  32.73 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  32.73 
 
 
415 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  32.21 
 
 
411 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  30.77 
 
 
414 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  28.19 
 
 
431 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  29.79 
 
 
341 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  28.57 
 
 
355 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  28.98 
 
 
385 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  27.43 
 
 
412 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  25.39 
 
 
404 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  27.51 
 
 
385 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  28.48 
 
 
384 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  29.11 
 
 
388 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  28.35 
 
 
380 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  24.46 
 
 
352 aa  99.4  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  28.35 
 
 
376 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  24.44 
 
 
381 aa  95.9  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  25.87 
 
 
351 aa  95.9  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>