165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3051 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  94.28 
 
 
332 aa  653    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
332 aa  686    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  76.44 
 
 
329 aa  531  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2878  6-phosphogluconolactonase  74.7 
 
 
331 aa  521  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  68.29 
 
 
334 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  68.18 
 
 
331 aa  475  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  67.99 
 
 
334 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  62.54 
 
 
331 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  62.24 
 
 
331 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  62.24 
 
 
331 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  62.24 
 
 
331 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  62.24 
 
 
331 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  62.24 
 
 
331 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  61.63 
 
 
331 aa  418  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  61.93 
 
 
331 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.923761 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  61.63 
 
 
331 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  61.63 
 
 
331 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  61.63 
 
 
331 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  61.63 
 
 
331 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  61.03 
 
 
331 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0244  6-phosphogluconolactonase  51.35 
 
 
333 aa  362  6e-99  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  41.52 
 
 
363 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  37.46 
 
 
367 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  38.14 
 
 
375 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  38.25 
 
 
363 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  37.24 
 
 
363 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  37.24 
 
 
363 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  37.36 
 
 
380 aa  215  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  36.78 
 
 
386 aa  210  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  36.21 
 
 
386 aa  208  9e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  33.14 
 
 
359 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  32.29 
 
 
377 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  31.83 
 
 
373 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5499  3-carboxymuconate cyclase-like  30.55 
 
 
349 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  32.93 
 
 
350 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1090  6-phosphogluconolactonase  30.03 
 
 
348 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2199  6-phosphogluconolactonase  29.74 
 
 
348 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5895  3-carboxymuconate cyclase-like  29.94 
 
 
349 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2221  3-carboxymuconate cyclase-like protein  30.23 
 
 
349 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2182  3-carboxymuconate cyclase-like protein  29.94 
 
 
349 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2099  6-phosphogluconolactonase  30.43 
 
 
349 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6529  6-phosphogluconolactonase  30.51 
 
 
359 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111343  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  29.66 
 
 
375 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  33.45 
 
 
412 aa  142  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  32.1 
 
 
410 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  28.99 
 
 
353 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  33.47 
 
 
350 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  31.05 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  30.5 
 
 
414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  33.56 
 
 
351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  29.93 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  27.86 
 
 
355 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  27.57 
 
 
354 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  27.63 
 
 
374 aa  126  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  27.27 
 
 
354 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  29.8 
 
 
411 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  30.13 
 
 
411 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  29.8 
 
 
391 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  29.8 
 
 
411 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  30.13 
 
 
411 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  29.8 
 
 
391 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  29.8 
 
 
391 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  28.36 
 
 
355 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  29.79 
 
 
372 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  27.14 
 
 
355 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  32.26 
 
 
363 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  26.98 
 
 
355 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  27.14 
 
 
353 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  32.43 
 
 
411 aa  122  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  29.52 
 
 
349 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  30.1 
 
 
348 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  32.34 
 
 
351 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  27.69 
 
 
353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  29.29 
 
 
431 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  25.71 
 
 
354 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  29.27 
 
 
376 aa  116  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  31.41 
 
 
414 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  26.9 
 
 
355 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  27.33 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  28.27 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  28.4 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  31.33 
 
 
388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  31.97 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  30.68 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  27.93 
 
 
339 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  31.88 
 
 
385 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  32.73 
 
 
415 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32.73 
 
 
415 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  26.53 
 
 
352 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  32.73 
 
 
415 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  27.3 
 
 
370 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  27.86 
 
 
342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  28.92 
 
 
376 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  26.99 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  27.82 
 
 
341 aa  109  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  31.52 
 
 
415 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  31.47 
 
 
414 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  35.09 
 
 
345 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  31.1 
 
 
388 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  31.13 
 
 
415 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.695665 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>