200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0450 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
384 aa  794    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  40.52 
 
 
370 aa  253  6e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  37.77 
 
 
376 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  37.66 
 
 
411 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  37.16 
 
 
411 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  37.41 
 
 
411 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  37.16 
 
 
411 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  37.41 
 
 
411 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  37.16 
 
 
391 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  37.16 
 
 
391 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  37.44 
 
 
385 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  36.91 
 
 
391 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  38.78 
 
 
415 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  38.78 
 
 
415 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  38.78 
 
 
415 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  37.24 
 
 
375 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  39.03 
 
 
414 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  35.77 
 
 
372 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  37.91 
 
 
414 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  37.2 
 
 
431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  37.18 
 
 
385 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  37.4 
 
 
415 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  37.4 
 
 
415 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  36.8 
 
 
353 aa  206  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  33.33 
 
 
390 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  33.78 
 
 
363 aa  203  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  35.23 
 
 
373 aa  202  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  31.42 
 
 
394 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  32.45 
 
 
388 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  31.95 
 
 
388 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  33.76 
 
 
376 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  35.58 
 
 
355 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  31.52 
 
 
374 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  33.15 
 
 
380 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  33.15 
 
 
376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  33.8 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  32.61 
 
 
380 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  32.62 
 
 
391 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  33.15 
 
 
351 aa  179  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  33.6 
 
 
354 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  33.33 
 
 
354 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  33.51 
 
 
355 aa  176  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  33.78 
 
 
353 aa  173  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  32.98 
 
 
355 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  32.07 
 
 
354 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  32.88 
 
 
355 aa  169  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  32.71 
 
 
353 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  32.97 
 
 
355 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  33.24 
 
 
355 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  31.27 
 
 
412 aa  162  7e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  29.97 
 
 
352 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  29.27 
 
 
376 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  31.28 
 
 
350 aa  152  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  33.98 
 
 
379 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  32.88 
 
 
345 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  29.84 
 
 
348 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  32.78 
 
 
353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  31.28 
 
 
368 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  29.33 
 
 
351 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  29.74 
 
 
410 aa  142  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  34.78 
 
 
367 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  29.89 
 
 
414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  28.98 
 
 
418 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  28.87 
 
 
412 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  29.75 
 
 
372 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  29.69 
 
 
339 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  30.08 
 
 
338 aa  138  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  29.19 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  30.08 
 
 
342 aa  136  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  28.97 
 
 
342 aa  136  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  27.75 
 
 
412 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  29.69 
 
 
339 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  27.99 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  29.81 
 
 
410 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  31.75 
 
 
363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  31.75 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  29.64 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  30.58 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  27.08 
 
 
380 aa  130  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  31.75 
 
 
363 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  28.76 
 
 
404 aa  129  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  31.16 
 
 
363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001405  hypothetical protein  28.06 
 
 
344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06344  6-phosphogluconolactonase  28.3 
 
 
348 aa  127  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  29.71 
 
 
359 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  28.07 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  29.73 
 
 
354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  30.12 
 
 
331 aa  119  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  27.3 
 
 
377 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  27.48 
 
 
386 aa  116  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  27.33 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  25.97 
 
 
386 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  27.35 
 
 
332 aa  113  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  29.91 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1349  6-phosphogluconolactonase  29.19 
 
 
340 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000593187  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  29.12 
 
 
331 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  27.12 
 
 
329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31940  3-carboxymuconate cyclase  27.3 
 
 
368 aa  110  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  29.91 
 
 
331 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  29.91 
 
 
331 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>