221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2361 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  99.04 
 
 		 415 aa  827    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  90.07 
 
 		 414 aa  758    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  90.84 
 
 		 415 aa  773    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  100 
 
 		 415 aa  836    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  90.84 
 
 		 415 aa  773    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  88.62 
 
 		 414 aa  750    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  90.84 
 
 		 415 aa  773    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  74.63 
 
 		 411 aa  616  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  74.12 
 
 		 411 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  74.37 
 
 		 411 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  74.12 
 
 		 411 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  74.37 
 
 		 411 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  73.85 
 
 		 391 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  73.59 
 
 		 391 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  73.85 
 
 		 391 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  71.97 
 
 		 431 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  70.94 
 
 		 385 aa  557  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  71.2 
 
 		 385 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  46.89 
 
 		 388 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  47.15 
 
 		 388 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  44.17 
 
 		 376 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  43.53 
 
 		 363 aa  302  8.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  42.29 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  41.12 
 
 		 390 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  42.35 
 
 		 391 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  42.7 
 
 		 376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  41.67 
 
 		 376 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  41.87 
 
 		 380 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  41.11 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  40.05 
 
 		 372 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  39.79 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  41.44 
 
 		 375 aa  266  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  38.85 
 
 		 373 aa  249  9e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  34.94 
 
 		 374 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  35.73 
 
 		 355 aa  223  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  37.02 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  35.46 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  35.24 
 
 		 412 aa  219  5e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  35.18 
 
 		 354 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  36.01 
 
 		 355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  35.58 
 
 		 354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  36.26 
 
 		 355 aa  216  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  35.73 
 
 		 355 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  35.73 
 
 		 353 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  37.57 
 
 		 410 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  34.81 
 
 		 355 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  37.4 
 
 		 384 aa  212  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  35.47 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  35.93 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  35.18 
 
 		 376 aa  202  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  35.73 
 
 		 353 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  35 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  34.94 
 
 		 414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  34.07 
 
 		 352 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  34.1 
 
 		 350 aa  192  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  33.24 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  34.24 
 
 		 372 aa  189  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  36.08 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  32.12 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  33.88 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  31.38 
 
 		 404 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  35.76 
 
 		 345 aa  169  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  32.14 
 
 		 414 aa  167  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  32.36 
 
 		 341 aa  159  7e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  31.9 
 
 		 418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  35.47 
 
 		 353 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  29.31 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  30.25 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  32.8 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  34.67 
 
 		 379 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  30.52 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2566  hypothetical protein  35.06 
 
 		 332 aa  146  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  31.69 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  32.4 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  31.7 
 
 		 342 aa  143  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  29.89 
 
 		 412 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06344  6-phosphogluconolactonase  29.57 
 
 		 348 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  31.15 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  29.71 
 
 		 412 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  26.61 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  30.77 
 
 		 353 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  33.14 
 
 		 375 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  33.14 
 
 		 363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1978  hypothetical protein  28.36 
 
 		 342 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2011  hypothetical protein  28.36 
 
 		 342 aa  134  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  26.61 
 
 		 339 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  30.95 
 
 		 367 aa  133  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  33.14 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.799827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  30.97 
 
 		 369 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1349  6-phosphogluconolactonase  29.86 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000593187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2650  3-carboxymuconate cyclase  31.47 
 
 		 328 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  31.66 
 
 		 363 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  28.81 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  31.66 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  28.99 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001405  hypothetical protein  31.04 
 
 		 344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  31.33 
 
 		 361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0647  Domain of unknown function DUF2394  32.75 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0296594  hitchhiker  0.00133017 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31940  3-carboxymuconate cyclase  32.17 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0501  Domain of unknown function DUF2394  30.42 
 
 		 365 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>