226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5727 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
373 aa  759    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  48.04 
 
 
353 aa  334  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  44.72 
 
 
376 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  42.53 
 
 
349 aa  286  4e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  40.69 
 
 
412 aa  277  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  41.38 
 
 
355 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  40.86 
 
 
370 aa  272  9e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  41.21 
 
 
354 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  40.92 
 
 
354 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  38.78 
 
 
348 aa  266  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  41.09 
 
 
355 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  36.9 
 
 
376 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  40.23 
 
 
355 aa  263  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  41.9 
 
 
368 aa  262  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  40.8 
 
 
353 aa  262  8e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  40.8 
 
 
355 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  40.8 
 
 
353 aa  258  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  39.64 
 
 
414 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  39.79 
 
 
415 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  39.79 
 
 
415 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  40.52 
 
 
355 aa  256  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  39.79 
 
 
415 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  39.1 
 
 
372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  40.52 
 
 
355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  39.2 
 
 
350 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  39.89 
 
 
375 aa  252  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  42.35 
 
 
350 aa  249  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  38.08 
 
 
363 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  38.85 
 
 
415 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  39.29 
 
 
414 aa  248  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  41.58 
 
 
385 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  38.58 
 
 
415 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  37.18 
 
 
351 aa  247  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  38.6 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  36.99 
 
 
352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  38.53 
 
 
411 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  38.53 
 
 
391 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  38.53 
 
 
411 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  38.53 
 
 
391 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  38.53 
 
 
411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  38.53 
 
 
411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  38.24 
 
 
391 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  38.38 
 
 
385 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  38.24 
 
 
411 aa  240  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  36.79 
 
 
410 aa  236  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  36.81 
 
 
354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  38.92 
 
 
414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  33.98 
 
 
414 aa  225  9e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  35.57 
 
 
374 aa  225  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  36.15 
 
 
372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  36.26 
 
 
394 aa  216  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  37.5 
 
 
351 aa  215  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  34.92 
 
 
380 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  38.18 
 
 
341 aa  211  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  35.62 
 
 
390 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  35.48 
 
 
418 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  36.48 
 
 
391 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  35.23 
 
 
384 aa  202  7e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  34.13 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  34.31 
 
 
376 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  35.12 
 
 
412 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  34.13 
 
 
380 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  34.95 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  33.14 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  34.75 
 
 
353 aa  195  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  34.23 
 
 
388 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  33.69 
 
 
388 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  33.8 
 
 
379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  36.28 
 
 
367 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  34.9 
 
 
410 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  32.21 
 
 
404 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  35.38 
 
 
345 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  35.76 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  33.05 
 
 
354 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  30.68 
 
 
339 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  35.03 
 
 
331 aa  176  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  32.03 
 
 
351 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  30.92 
 
 
353 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  29.83 
 
 
339 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  32.63 
 
 
334 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  32.63 
 
 
334 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  31.5 
 
 
363 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  32.15 
 
 
369 aa  165  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  32.13 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  33.14 
 
 
381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  32.41 
 
 
352 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.799827 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  31.3 
 
 
338 aa  161  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  31.83 
 
 
332 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1349  6-phosphogluconolactonase  30.75 
 
 
340 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000593187  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  31.56 
 
 
331 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  29.34 
 
 
342 aa  158  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0244  6-phosphogluconolactonase  30.94 
 
 
333 aa  157  2e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  32.92 
 
 
331 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  32.92 
 
 
331 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  32.92 
 
 
331 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  32.92 
 
 
331 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  31.27 
 
 
331 aa  157  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  31.27 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  31.27 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  31.27 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>