153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2456 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  702    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  48.53 
 
 
342 aa  345  6e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  49.11 
 
 
342 aa  324  1e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  42.9 
 
 
338 aa  278  8e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1349  6-phosphogluconolactonase  42.01 
 
 
340 aa  267  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000593187  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  41 
 
 
355 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  40.24 
 
 
354 aa  255  9e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  39.94 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  40.52 
 
 
355 aa  252  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  42.86 
 
 
354 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  40.88 
 
 
353 aa  251  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  39.82 
 
 
355 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  39.23 
 
 
352 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  39.53 
 
 
353 aa  245  9e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  39.53 
 
 
355 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  40.12 
 
 
355 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  38.48 
 
 
355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  38.18 
 
 
373 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1978  hypothetical protein  34.99 
 
 
342 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2011  hypothetical protein  34.99 
 
 
342 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  36.47 
 
 
342 aa  198  9e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  33.14 
 
 
372 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  35.71 
 
 
376 aa  189  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  34.1 
 
 
353 aa  182  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  33.82 
 
 
351 aa  182  8.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  34.48 
 
 
385 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  33.62 
 
 
372 aa  176  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  35.55 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  33.81 
 
 
431 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  33.91 
 
 
385 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  33.13 
 
 
370 aa  169  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  29.82 
 
 
339 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  30.41 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  30.79 
 
 
412 aa  166  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  31.3 
 
 
411 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  31.49 
 
 
411 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  31.49 
 
 
391 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  31.49 
 
 
411 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  31.49 
 
 
391 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  31.49 
 
 
411 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  32.07 
 
 
415 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32.07 
 
 
415 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  31.49 
 
 
411 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  31.49 
 
 
391 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  32.07 
 
 
415 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  31.32 
 
 
376 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  31.78 
 
 
414 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  30.75 
 
 
414 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32.36 
 
 
415 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  34.44 
 
 
350 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  32.07 
 
 
415 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  28.65 
 
 
338 aa  155  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  34.32 
 
 
404 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  29.79 
 
 
348 aa  152  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  33.24 
 
 
345 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  32.1 
 
 
388 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  32.1 
 
 
388 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  33.66 
 
 
368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  29.34 
 
 
374 aa  146  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  29.94 
 
 
375 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  30.84 
 
 
349 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  31.03 
 
 
351 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  29.11 
 
 
410 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  29.52 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  29.24 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  30.06 
 
 
394 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  29.78 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  29.15 
 
 
351 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001405  hypothetical protein  32.06 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  29.65 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  29.64 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  27.25 
 
 
380 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  27.95 
 
 
410 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  27.08 
 
 
376 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  28.29 
 
 
391 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  27.08 
 
 
380 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  28.93 
 
 
353 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  29.71 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  28.53 
 
 
334 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  28.53 
 
 
334 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  32.02 
 
 
367 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  26.87 
 
 
376 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0501  Domain of unknown function DUF2394  29.52 
 
 
365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  27.01 
 
 
361 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2566  hypothetical protein  29.97 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  29.92 
 
 
332 aa  116  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  29.19 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.799827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  31.3 
 
 
418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06344  6-phosphogluconolactonase  30.12 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  29.29 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  29.66 
 
 
379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  26.77 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  27.93 
 
 
353 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  30.43 
 
 
331 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  30.43 
 
 
331 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  30.43 
 
 
331 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  30.43 
 
 
331 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  28.39 
 
 
329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  27.82 
 
 
332 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  30.43 
 
 
331 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>