211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2435 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
353 aa  724    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  48.04 
 
 
373 aa  334  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  39.83 
 
 
376 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  39.33 
 
 
412 aa  249  7e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  36.6 
 
 
350 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  37.08 
 
 
354 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  36.69 
 
 
355 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  37.54 
 
 
353 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  36.24 
 
 
354 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  36.69 
 
 
355 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  36.59 
 
 
355 aa  236  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  36.59 
 
 
355 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  36.59 
 
 
353 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  36.93 
 
 
414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  36.97 
 
 
355 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  32.69 
 
 
376 aa  230  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  36.39 
 
 
349 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  39.94 
 
 
350 aa  228  9e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  35.73 
 
 
352 aa  226  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  34.75 
 
 
355 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  34.46 
 
 
410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  38.75 
 
 
370 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  35.33 
 
 
372 aa  219  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  36.59 
 
 
368 aa  219  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  34.77 
 
 
354 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  33.05 
 
 
348 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  38.27 
 
 
385 aa  212  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  36.17 
 
 
414 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  36.39 
 
 
385 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  37.23 
 
 
414 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  37.5 
 
 
415 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  37.5 
 
 
415 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  37.5 
 
 
415 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  35 
 
 
374 aa  208  9e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  36.84 
 
 
411 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  36.57 
 
 
431 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  34.66 
 
 
375 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  36.39 
 
 
411 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  36.39 
 
 
411 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  36.8 
 
 
384 aa  206  6e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  36.67 
 
 
411 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  36.39 
 
 
391 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  36.67 
 
 
411 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  36.39 
 
 
391 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  36.11 
 
 
391 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  34.9 
 
 
363 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  36.01 
 
 
415 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  33.43 
 
 
351 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  35.73 
 
 
415 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  31.61 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  32.3 
 
 
404 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  35.23 
 
 
353 aa  188  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  34.52 
 
 
412 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  34.15 
 
 
418 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  31.2 
 
 
372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  34.1 
 
 
341 aa  182  7e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  33.97 
 
 
412 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  28.53 
 
 
414 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  33.14 
 
 
379 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  32.83 
 
 
381 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  32.77 
 
 
388 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  30.11 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  30.81 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  32.49 
 
 
388 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  30.33 
 
 
394 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  29.87 
 
 
369 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  33.64 
 
 
363 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
363 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  29.71 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  33.02 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  33.02 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  34.39 
 
 
345 aa  162  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  29.86 
 
 
376 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  30.81 
 
 
339 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  31.68 
 
 
391 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  31.09 
 
 
380 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  31.09 
 
 
376 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  30.74 
 
 
363 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  31.53 
 
 
367 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  29.3 
 
 
380 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  31.01 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  30.79 
 
 
342 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  29.27 
 
 
331 aa  152  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2878  6-phosphogluconolactonase  30.43 
 
 
331 aa  152  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  32.38 
 
 
410 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  33.24 
 
 
352 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.799827 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1978  hypothetical protein  31.03 
 
 
342 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2011  hypothetical protein  31.03 
 
 
342 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  29.63 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  29.63 
 
 
334 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  29.86 
 
 
332 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  30.84 
 
 
342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1349  6-phosphogluconolactonase  26.8 
 
 
340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000593187  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  28.78 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  29.12 
 
 
338 aa  144  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  31.8 
 
 
361 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  28.66 
 
 
331 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  28.66 
 
 
331 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  28.66 
 
 
331 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  28.66 
 
 
331 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>