152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2566 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2566  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  670    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  41.72 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  41.48 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  38.18 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  39.2 
 
 		 414 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  37.61 
 
 		 350 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  37.97 
 
 		 369 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  34.65 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  34.78 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  32.02 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  32.15 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  32.74 
 
 		 412 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  36.14 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  35.98 
 
 		 414 aa  155  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  36.28 
 
 		 414 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  36.36 
 
 		 376 aa  152  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  32.44 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  35.06 
 
 		 415 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  35.06 
 
 		 415 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  35.06 
 
 		 415 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  35.37 
 
 		 415 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  37.33 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  32.11 
 
 		 375 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  32.72 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  29.78 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  35.06 
 
 		 415 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  33.64 
 
 		 385 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  29.39 
 
 		 354 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  29.07 
 
 		 354 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  33.43 
 
 		 418 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  28.4 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  33.73 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  29.41 
 
 		 372 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  33.63 
 
 		 411 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  33.63 
 
 		 411 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  29.72 
 
 		 354 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  33.33 
 
 		 391 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  33.33 
 
 		 391 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  33.33 
 
 		 391 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  33.33 
 
 		 411 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  33.33 
 
 		 411 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  31.6 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  29.63 
 
 		 368 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  28.98 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  31.8 
 
 		 431 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  28.98 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  28.66 
 
 		 355 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  28.66 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  28.66 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  29.02 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  28.66 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  28.03 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  29.82 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  32.38 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  28.62 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  29.3 
 
 		 373 aa  132  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  35.8 
 
 		 379 aa  132  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  32.32 
 
 		 351 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  30.67 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  31.69 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  28.61 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  25.32 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  28.74 
 
 		 412 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  34.06 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  31.9 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  30.5 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  31.42 
 
 		 352 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.799827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  30.28 
 
 		 380 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  29.97 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  32.58 
 
 		 351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  29.11 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44009  predicted protein  26.8 
 
 		 526 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.123695  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  28.81 
 
 		 363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  29.6 
 
 		 342 aa  112  9e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1978  hypothetical protein  28.03 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2011  hypothetical protein  28.03 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06344  6-phosphogluconolactonase  31.03 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2650  3-carboxymuconate cyclase  31.72 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  28.79 
 
 		 390 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  31.79 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  33.33 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1349  6-phosphogluconolactonase  27.24 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000593187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  28.62 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  30.16 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  26.41 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  29.52 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  23.96 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  23.96 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  25.07 
 
 		 384 aa  97.4  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  28.62 
 
 		 342 aa  95.9  8e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  27.91 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  29.21 
 
 		 375 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  29.21 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001405  hypothetical protein  30.16 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  26.52 
 
 		 338 aa  92.8  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  27.8 
 
 		 410 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  25.81 
 
 		 338 aa  90.9  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1746  3-carboxymuconate cyclase-like protein  24.57 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00917254  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0647  Domain of unknown function DUF2394  28.97 
 
 		 366 aa  89.7  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0296594  hitchhiker  0.00133017 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  26.69 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>