230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1585 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  40.11 
 
 		 412 aa  222  8e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  43.37 
 
 		 351 aa  219  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  44.93 
 
 		 379 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  36.63 
 
 		 354 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  36.34 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  41.24 
 
 		 351 aa  209  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  35.65 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  35.77 
 
 		 376 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  39.48 
 
 		 414 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  42.17 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  43.02 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2650  3-carboxymuconate cyclase  41.57 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  35.36 
 
 		 355 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  39.83 
 
 		 350 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  40.52 
 
 		 410 aa  202  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  35.94 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  34.2 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  35.07 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  34.49 
 
 		 355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  34.3 
 
 		 352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  39.94 
 
 		 350 aa  199  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  35.07 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  35.07 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  34.78 
 
 		 355 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  39.43 
 
 		 353 aa  195  9e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  39.94 
 
 		 414 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  36.5 
 
 		 370 aa  189  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  35.45 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  37.21 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  40.56 
 
 		 351 aa  186  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  39.36 
 
 		 354 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  38.98 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  35.38 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  36.78 
 
 		 385 aa  175  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  36.5 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  36.47 
 
 		 415 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  36.47 
 
 		 415 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  36.47 
 
 		 415 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  35.89 
 
 		 363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  37.65 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  35.03 
 
 		 404 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  36.58 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  38.37 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0501  Domain of unknown function DUF2394  40.06 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  36.05 
 
 		 415 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  36.39 
 
 		 381 aa  170  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  35.76 
 
 		 415 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  34.31 
 
 		 368 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  36.63 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  36.63 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  36.63 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  36.63 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  36.63 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  36.63 
 
 		 411 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  36.63 
 
 		 411 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  36.34 
 
 		 391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  35.59 
 
 		 380 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  35.88 
 
 		 376 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  35.94 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  35.59 
 
 		 380 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  34.39 
 
 		 353 aa  162  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  30.72 
 
 		 374 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  33.96 
 
 		 412 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  36.14 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  33.7 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1978  hypothetical protein  30.23 
 
 		 342 aa  153  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2011  hypothetical protein  30.23 
 
 		 342 aa  153  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  34.72 
 
 		 376 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1349  6-phosphogluconolactonase  31.66 
 
 		 340 aa  152  8.999999999999999e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000593187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  30.65 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31940  3-carboxymuconate cyclase  36.67 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  33.24 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  32.88 
 
 		 384 aa  149  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  31.79 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  36.81 
 
 		 361 aa  149  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2566  hypothetical protein  37.33 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001405  hypothetical protein  34.47 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  32.26 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  36.23 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.799827 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2089  hypothetical protein  34.3 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  32.88 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  32.54 
 
 		 394 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  32.54 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06344  6-phosphogluconolactonase  34.2 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  33.62 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0647  Domain of unknown function DUF2394  33.43 
 
 		 366 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0296594  hitchhiker  0.00133017 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  31.88 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  33.97 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  25.93 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2754  hypothetical protein  39.41 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  36.28 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  26.05 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  35.4 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0723  putative secreted protein  36.71 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.780162 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  26.7 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  35.53 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2974  hypothetical protein  35.52 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  34.04 
 
 		 329 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>