114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2089 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2089  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  764    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31940  3-carboxymuconate cyclase  41.38 
 
 		 368 aa  222  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  33.15 
 
 		 353 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  34.3 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  32.47 
 
 		 412 aa  149  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  34.57 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0501  Domain of unknown function DUF2394  33.62 
 
 		 365 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0647  Domain of unknown function DUF2394  32.9 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0296594  hitchhiker  0.00133017 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  28.15 
 
 		 355 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  29.41 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  29.41 
 
 		 354 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  29.81 
 
 		 349 aa  132  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  29.6 
 
 		 355 aa  132  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  32.35 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  29.26 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  33.51 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  29.07 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  28.31 
 
 		 353 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  28.8 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2974  hypothetical protein  34.32 
 
 		 361 aa  127  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  28.8 
 
 		 353 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0723  putative secreted protein  34.21 
 
 		 365 aa  125  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.780162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  28.28 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  28.28 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  28.8 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  28.57 
 
 		 348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  28.61 
 
 		 372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  26.99 
 
 		 380 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  29.26 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  28.84 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.799827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  26.7 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  25.07 
 
 		 370 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06344  6-phosphogluconolactonase  27.2 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  27.08 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  26.41 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  26.72 
 
 		 355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  27.6 
 
 		 372 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  28.61 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  28.46 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  28.46 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  28.46 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  28.46 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  28.46 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  28.46 
 
 		 391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  28.46 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  26.01 
 
 		 384 aa  109  8.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  28.19 
 
 		 411 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  29.32 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  28.91 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  29.53 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  28.23 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2650  3-carboxymuconate cyclase  31.55 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  27.08 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  28.1 
 
 		 415 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  28.1 
 
 		 415 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  28.1 
 
 		 415 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  24.74 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  30.15 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  26.3 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  28.23 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001405  hypothetical protein  25.87 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  30.33 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  30.05 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  27.6 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  27.96 
 
 		 415 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  22.37 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  28.03 
 
 		 414 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  25.26 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  25.94 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  24.32 
 
 		 342 aa  94  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  21.62 
 
 		 339 aa  92.8  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  30.2 
 
 		 418 aa  92.8  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  28.65 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  29.18 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  28.89 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  25 
 
 		 353 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  24.39 
 
 		 338 aa  90.1  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  27.91 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  24.12 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  25.39 
 
 		 341 aa  87  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  27.3 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  27.95 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4229  putative secreted protein  28 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  23.96 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  27.59 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  26.82 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  26.43 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  24.52 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1349  6-phosphogluconolactonase  23.72 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000593187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  25.73 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  26.58 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  24.19 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2754  hypothetical protein  30.06 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113046 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  26.28 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  25.68 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1978  hypothetical protein  21.19 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2011  hypothetical protein  21.19 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24050  3-carboxymuconate cyclase  27.53 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01440  expressed protein  30.96 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  22.75 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>