98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4229 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4229  putative secreted protein  100 
 
 		 340 aa  647    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  39.43 
 
 		 379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  38.04 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0501  Domain of unknown function DUF2394  37.27 
 
 		 365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2754  hypothetical protein  36.55 
 
 		 314 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113046 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31940  3-carboxymuconate cyclase  36.93 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  35.04 
 
 		 353 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  30.92 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  31.21 
 
 		 348 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  31.49 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  28.53 
 
 		 376 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  27.95 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  27.78 
 
 		 370 aa  102  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  33.53 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  33.05 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  23.41 
 
 		 372 aa  97.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0723  putative secreted protein  36.25 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.780162 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  32.63 
 
 		 415 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  32.63 
 
 		 415 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32.63 
 
 		 415 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  30.36 
 
 		 385 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06344  6-phosphogluconolactonase  28.86 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32.54 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0647  Domain of unknown function DUF2394  31.83 
 
 		 366 aa  89.7  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0296594  hitchhiker  0.00133017 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  32.24 
 
 		 415 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  31.59 
 
 		 414 aa  89.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  29.31 
 
 		 349 aa  87.8  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2974  hypothetical protein  34.64 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001405  hypothetical protein  27.17 
 
 		 344 aa  86.7  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  27.37 
 
 		 431 aa  86.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  30.29 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  27.55 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  27.44 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  30.54 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  29.78 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  30.06 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  28.48 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  28.94 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  32.7 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  25.65 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  32.09 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2973  NHL repeat containing protein  32.58 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.982781 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  24.66 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  28.53 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  29.17 
 
 		 411 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  29.17 
 
 		 411 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  25.11 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  35.24 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24050  3-carboxymuconate cyclase  33.56 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  29.38 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  29.17 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  24.78 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  24.93 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  28.87 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  28.87 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  28.87 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  28.87 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  25.22 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  25.93 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  25.93 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  24.45 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  24.45 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0481  putative ATP/GTP-binding protein  29.43 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  27.27 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2089  hypothetical protein  28 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  24.54 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  24.89 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  29.6 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  26.18 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3443  3-carboxymuconate cyclase-like protein  28.98 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  29.6 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  26.07 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  28.11 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  29.27 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  29.5 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  27.62 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  29.61 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  29.5 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  23.89 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  28.53 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  26.39 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  30.29 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.799827 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  21.16 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2650  3-carboxymuconate cyclase  29.22 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  25.83 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  26.67 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  29.11 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  25.37 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  28.44 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  28.81 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  28.06 
 
 		 388 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03720  expressed protein  26.77 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.385161  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02112  conserved hypothetical protein  34.91 
 
 		 409 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2566  hypothetical protein  30.25 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01440  expressed protein  33.71 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  26.8 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  26 
 
 		 377 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1974  6-phosphogluconolactonase  25.67 
 
 		 340 aa  43.1  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.290723  normal  0.0128629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>