152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1974 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1974  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 		 340 aa  682    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.290723  normal  0.0128629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2099  6-phosphogluconolactonase  37.43 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5499  3-carboxymuconate cyclase-like  38.08 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2221  3-carboxymuconate cyclase-like protein  36.73 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  31.12 
 
 		 386 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5895  3-carboxymuconate cyclase-like  34.71 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2182  3-carboxymuconate cyclase-like protein  34.71 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2199  6-phosphogluconolactonase  34.51 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1090  6-phosphogluconolactonase  35.42 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  32.09 
 
 		 380 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  31.12 
 
 		 386 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  33.43 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  33.43 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  33.33 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  33.33 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  29.86 
 
 		 359 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  29.86 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6529  6-phosphogluconolactonase  34.28 
 
 		 359 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111343  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  29.02 
 
 		 363 aa  139  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  31.73 
 
 		 367 aa  139  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  26.1 
 
 		 331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  26.1 
 
 		 331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  26.1 
 
 		 331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  26.1 
 
 		 331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  26.1 
 
 		 331 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  25.81 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  25.81 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  25.07 
 
 		 331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  25.07 
 
 		 331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  25.07 
 
 		 331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  25.07 
 
 		 331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  25.07 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  25.94 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  26.38 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  27.3 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2878  6-phosphogluconolactonase  26.59 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  25.57 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  25.5 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0244  6-phosphogluconolactonase  24.64 
 
 		 333 aa  102  6e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  31.52 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  30.91 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  28.35 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  31.32 
 
 		 415 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  31.32 
 
 		 415 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  24.13 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  24.13 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  31.32 
 
 		 415 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  30.28 
 
 		 414 aa  96.3  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  31.35 
 
 		 411 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  30.95 
 
 		 411 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  31.35 
 
 		 411 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  26.49 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  30.95 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  30.95 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  30.95 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  30.95 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  30.95 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  29.66 
 
 		 414 aa  93.2  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  30.03 
 
 		 431 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  29.03 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  29.81 
 
 		 415 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  30.68 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  29.73 
 
 		 385 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  26.85 
 
 		 373 aa  89.7  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  29.43 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  29.59 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  25.38 
 
 		 372 aa  87  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  29.85 
 
 		 380 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  26.19 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  28.37 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  26.47 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  28.81 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  26.96 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  26.69 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  25.92 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  24.4 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  28.15 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  26.96 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  25.53 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  24.53 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  29.41 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  23.82 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  29.41 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  23.89 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  24.14 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  26.27 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  27.46 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  24.21 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  24.21 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  26.91 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  23.9 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  27.14 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  24.01 
 
 		 352 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  27.33 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  24.74 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  23.97 
 
 		 370 aa  72.4  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  29.41 
 
 		 418 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  26.91 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  27.78 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  23.94 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>