169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6529 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6529  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
359 aa  723    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111343  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5499  3-carboxymuconate cyclase-like  50.72 
 
 
349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5895  3-carboxymuconate cyclase-like  50.72 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2182  3-carboxymuconate cyclase-like protein  50.72 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2199  6-phosphogluconolactonase  50.43 
 
 
348 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2099  6-phosphogluconolactonase  48.99 
 
 
349 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2221  3-carboxymuconate cyclase-like protein  48.7 
 
 
349 aa  301  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1090  6-phosphogluconolactonase  47.54 
 
 
348 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  40.34 
 
 
386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  38.76 
 
 
386 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  40.17 
 
 
380 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  38.12 
 
 
375 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  38.12 
 
 
363 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  37.29 
 
 
367 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  37.85 
 
 
363 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  36.54 
 
 
363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  37.04 
 
 
363 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  35.33 
 
 
359 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  34.16 
 
 
377 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  32.15 
 
 
331 aa  159  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  31.83 
 
 
331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  31.83 
 
 
331 aa  153  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  31.83 
 
 
331 aa  153  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  31.83 
 
 
331 aa  153  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  31.83 
 
 
331 aa  153  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  31.83 
 
 
331 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  31.95 
 
 
331 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  31.95 
 
 
331 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  31.95 
 
 
331 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  31.95 
 
 
331 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  30.63 
 
 
332 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  31.63 
 
 
331 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  31.19 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  30.51 
 
 
332 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  30 
 
 
329 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1974  6-phosphogluconolactonase  34.28 
 
 
340 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.290723  normal  0.0128629 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  32.45 
 
 
331 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2878  6-phosphogluconolactonase  28.79 
 
 
331 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  31.76 
 
 
334 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  31.76 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0244  6-phosphogluconolactonase  28.66 
 
 
333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  25.83 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  27.6 
 
 
368 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  24.93 
 
 
353 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  25 
 
 
370 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  28.13 
 
 
414 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  27.65 
 
 
415 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  25 
 
 
374 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  27.37 
 
 
415 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  27.47 
 
 
414 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  27.35 
 
 
415 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  27.35 
 
 
415 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  27.35 
 
 
415 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  25.36 
 
 
348 aa  99.4  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  24.41 
 
 
372 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  27.68 
 
 
349 aa  98.6  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  27.4 
 
 
431 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  27.16 
 
 
354 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  26.84 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  26.57 
 
 
385 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  28.13 
 
 
411 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  24.48 
 
 
355 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  24.68 
 
 
353 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  23.28 
 
 
355 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  24.35 
 
 
355 aa  93.2  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  27.3 
 
 
350 aa  92.8  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  26.92 
 
 
372 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  27.33 
 
 
342 aa  92  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  26.07 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  28.29 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  25.29 
 
 
375 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  21.92 
 
 
354 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  22.84 
 
 
354 aa  89.7  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  27.07 
 
 
391 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  27.07 
 
 
391 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  27.07 
 
 
411 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  27.07 
 
 
411 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  25.14 
 
 
388 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  22.16 
 
 
355 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  22.22 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  26.33 
 
 
411 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  26.33 
 
 
411 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  23.08 
 
 
355 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  26.8 
 
 
391 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  25.27 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  28.82 
 
 
410 aa  87.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  22.01 
 
 
352 aa  87  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  21.56 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  21.56 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  25.07 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  22.55 
 
 
341 aa  79.3  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  28.44 
 
 
363 aa  79.3  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  29.44 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  22.49 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  24.09 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  27.68 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.36 
 
 
521 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  22.35 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  23.96 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  27.06 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>