220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3105 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
368 aa  757    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  41.78 
 
 
373 aa  269  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  38.04 
 
 
376 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  37.63 
 
 
370 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  36.59 
 
 
353 aa  219  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  33.95 
 
 
376 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  39.35 
 
 
350 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  34.01 
 
 
352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  36.44 
 
 
354 aa  215  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  34.11 
 
 
412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  35.33 
 
 
354 aa  212  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  35.53 
 
 
355 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  35.63 
 
 
355 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  35.24 
 
 
353 aa  209  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  35.34 
 
 
355 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  34.77 
 
 
355 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  36.45 
 
 
349 aa  206  6e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  35.16 
 
 
351 aa  205  8e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  35.51 
 
 
355 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  33.91 
 
 
354 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  35.06 
 
 
355 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  35.51 
 
 
353 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  33.61 
 
 
404 aa  199  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  33.16 
 
 
411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  33.25 
 
 
391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  33.16 
 
 
411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  33.25 
 
 
391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  32.27 
 
 
348 aa  196  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  32.66 
 
 
411 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  32.66 
 
 
411 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  33.68 
 
 
415 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  33.24 
 
 
372 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  32.74 
 
 
391 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  33.68 
 
 
415 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  32.66 
 
 
411 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  32.9 
 
 
415 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  32.9 
 
 
415 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32.9 
 
 
415 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  32.11 
 
 
414 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  35.07 
 
 
353 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  33.86 
 
 
414 aa  186  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  31.98 
 
 
372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  34.74 
 
 
418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  32.64 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  32.96 
 
 
385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  32 
 
 
350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  31.03 
 
 
431 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  35.1 
 
 
412 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  34.51 
 
 
412 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  33.43 
 
 
354 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  34.04 
 
 
375 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  32.66 
 
 
414 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  31.82 
 
 
410 aa  179  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  33.43 
 
 
374 aa  178  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  33.63 
 
 
379 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  31.74 
 
 
390 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  31.17 
 
 
380 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  30.85 
 
 
376 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  32.95 
 
 
351 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  34.31 
 
 
345 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  29.84 
 
 
380 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  29.84 
 
 
376 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  30.75 
 
 
414 aa  167  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  33.52 
 
 
342 aa  167  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  30.61 
 
 
394 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  29.09 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1349  6-phosphogluconolactonase  35.21 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000593187  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  32.17 
 
 
391 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  32.46 
 
 
338 aa  164  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  31.16 
 
 
353 aa  162  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  31.91 
 
 
381 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1978  hypothetical protein  31.9 
 
 
342 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2011  hypothetical protein  31.9 
 
 
342 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  28.17 
 
 
388 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  31.62 
 
 
342 aa  156  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  34.94 
 
 
351 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  27.91 
 
 
388 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  31.01 
 
 
384 aa  149  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  33.66 
 
 
341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  31.46 
 
 
342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  28.08 
 
 
339 aa  146  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  28.37 
 
 
339 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  29.78 
 
 
380 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  28.73 
 
 
369 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  31.29 
 
 
363 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  30.66 
 
 
334 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  31.01 
 
 
363 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  30.66 
 
 
334 aa  143  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  30.87 
 
 
331 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  30.87 
 
 
331 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  30.87 
 
 
331 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  30.87 
 
 
331 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  30.83 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  30 
 
 
363 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2566  hypothetical protein  29.63 
 
 
332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  30 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  30.55 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  30.55 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  30.98 
 
 
363 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>