198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3768 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  801    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  92.82 
 
 		 394 aa  753    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  62.44 
 
 		 391 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  52.09 
 
 		 376 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  51.31 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  51.05 
 
 		 380 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  51.1 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  50.79 
 
 		 380 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  50.52 
 
 		 388 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  50.64 
 
 		 388 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  42.3 
 
 		 385 aa  305  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  42.47 
 
 		 385 aa  299  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  41.25 
 
 		 431 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  41.12 
 
 		 415 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  40.86 
 
 		 414 aa  288  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  40.86 
 
 		 415 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  43.37 
 
 		 411 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  42.82 
 
 		 411 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  42.82 
 
 		 411 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  42.82 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  40.36 
 
 		 415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  40.36 
 
 		 415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  42.82 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  42.82 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  42.82 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  40.36 
 
 		 415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  42.54 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  40.36 
 
 		 414 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  37.91 
 
 		 375 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  35.05 
 
 		 376 aa  233  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  36.2 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  36.8 
 
 		 372 aa  219  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  34.36 
 
 		 355 aa  210  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  35.62 
 
 		 373 aa  209  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  34.08 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  33.52 
 
 		 354 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  33.52 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  34.08 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  34.08 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  33.7 
 
 		 355 aa  202  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  32.69 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  32.61 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  33.43 
 
 		 355 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  32.03 
 
 		 353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  32.97 
 
 		 351 aa  196  7e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  32.31 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  31.22 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  30.54 
 
 		 412 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  31.58 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  30.65 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  31.95 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  29.71 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  30.37 
 
 		 348 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  29.72 
 
 		 372 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  28.82 
 
 		 339 aa  157  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  29.1 
 
 		 410 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  28.61 
 
 		 414 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  30.34 
 
 		 350 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  27.6 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  29.69 
 
 		 350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  29.97 
 
 		 418 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  29.71 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  32.54 
 
 		 345 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  30.27 
 
 		 404 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  27.79 
 
 		 376 aa  142  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  30.14 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  31.17 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  30.47 
 
 		 412 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  30.39 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  31.14 
 
 		 363 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  29.43 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  29.88 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  29.75 
 
 		 338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  30.29 
 
 		 363 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  26.92 
 
 		 338 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  29.78 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  31.7 
 
 		 381 aa  133  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  31.21 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  31.21 
 
 		 363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1349  6-phosphogluconolactonase  29.16 
 
 		 340 aa  129  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000593187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  29.66 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  29.87 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  28.05 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  28.93 
 
 		 353 aa  126  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001405  hypothetical protein  29.83 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  27.37 
 
 		 353 aa  122  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  27.84 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  27.47 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2650  3-carboxymuconate cyclase  30.03 
 
 		 328 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  28 
 
 		 363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  26.5 
 
 		 359 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  27.96 
 
 		 380 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1978  hypothetical protein  27.35 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2011  hypothetical protein  27.35 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  28.48 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  28.3 
 
 		 379 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  29.66 
 
 		 352 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.799827 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06344  6-phosphogluconolactonase  26.94 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  26.44 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>