193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5526 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
375 aa  776    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  50.99 
 
 
374 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  43.91 
 
 
376 aa  292  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  39.29 
 
 
372 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  41.83 
 
 
411 aa  269  7e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  41.83 
 
 
391 aa  269  7e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  41.83 
 
 
411 aa  269  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  41.83 
 
 
391 aa  269  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  41.27 
 
 
411 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  41.27 
 
 
411 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  41.27 
 
 
391 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  41.44 
 
 
415 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  41.55 
 
 
415 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  41.55 
 
 
415 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  41.55 
 
 
415 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  41.83 
 
 
414 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  40.72 
 
 
411 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  40.44 
 
 
431 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  39.61 
 
 
385 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  41.16 
 
 
415 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  41 
 
 
414 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  37.36 
 
 
370 aa  259  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  40.56 
 
 
385 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  38.61 
 
 
373 aa  253  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  38.19 
 
 
363 aa  239  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  36.44 
 
 
394 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  37.23 
 
 
390 aa  235  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  37.24 
 
 
384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  35.71 
 
 
380 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  38.48 
 
 
391 aa  222  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  35.62 
 
 
376 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  35.62 
 
 
380 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  33.82 
 
 
354 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  33.71 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  35.04 
 
 
376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  33.53 
 
 
354 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  35.05 
 
 
388 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  35.22 
 
 
388 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  33.14 
 
 
355 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  34.04 
 
 
355 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  33.43 
 
 
355 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  33.43 
 
 
353 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  33.14 
 
 
353 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  32.85 
 
 
355 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  34.66 
 
 
353 aa  206  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  34.89 
 
 
410 aa  206  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  36.71 
 
 
351 aa  205  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  34.3 
 
 
414 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  32.86 
 
 
355 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  31.94 
 
 
352 aa  199  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  34.69 
 
 
348 aa  199  7.999999999999999e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  35.16 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  35.21 
 
 
412 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  31.52 
 
 
354 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  31.88 
 
 
376 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  32.77 
 
 
350 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  36.17 
 
 
350 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  32.12 
 
 
414 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  34.04 
 
 
368 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  33.33 
 
 
351 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  30.72 
 
 
372 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  30.52 
 
 
404 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  33.33 
 
 
345 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  32.07 
 
 
354 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  31.56 
 
 
353 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  31.75 
 
 
351 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  32 
 
 
367 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  30.94 
 
 
412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2566  hypothetical protein  32.11 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  30.56 
 
 
381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  30.7 
 
 
332 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  30.72 
 
 
342 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  29.94 
 
 
341 aa  146  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  32.2 
 
 
375 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32.2 
 
 
363 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  29.66 
 
 
332 aa  143  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  30.33 
 
 
379 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  29.56 
 
 
412 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  28.16 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  29.83 
 
 
418 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  29.6 
 
 
380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  33.74 
 
 
329 aa  136  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  28.74 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  31.16 
 
 
342 aa  134  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  30.56 
 
 
342 aa  134  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  28.24 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  28.24 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  28.24 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  28.24 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  30.37 
 
 
352 aa  134  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.799827 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  28.32 
 
 
331 aa  133  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  28.24 
 
 
331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  31.48 
 
 
363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  29.32 
 
 
386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  30.95 
 
 
369 aa  129  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  31.75 
 
 
363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  28.29 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  28.29 
 
 
331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2878  6-phosphogluconolactonase  33.2 
 
 
331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  28.29 
 
 
331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>