163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0880 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  91.54 
 
 		 331 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 		 331 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  91.54 
 
 		 331 aa  637    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  91.54 
 
 		 331 aa  637    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 		 331 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  99.7 
 
 		 331 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 		 331 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 		 331 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  91.54 
 
 		 331 aa  637    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  91.24 
 
 		 331 aa  636    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  91.54 
 
 		 331 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  90.63 
 
 		 331 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  87.61 
 
 		 331 aa  621  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  63.44 
 
 		 332 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  62.54 
 
 		 329 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2878  6-phosphogluconolactonase  61.93 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  62.24 
 
 		 332 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  58.97 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  58.66 
 
 		 334 aa  391  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  58.31 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0244  6-phosphogluconolactonase  45.15 
 
 		 333 aa  325  6e-88  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  36.89 
 
 		 363 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  36.45 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  36.45 
 
 		 363 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  35.74 
 
 		 363 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  35.16 
 
 		 386 aa  195  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  34.94 
 
 		 363 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  34.85 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  35.65 
 
 		 380 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  33.62 
 
 		 386 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5499  3-carboxymuconate cyclase-like  31.53 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5895  3-carboxymuconate cyclase-like  31.12 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2182  3-carboxymuconate cyclase-like protein  31.12 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  30.35 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2221  3-carboxymuconate cyclase-like protein  31.25 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2099  6-phosphogluconolactonase  30.4 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2199  6-phosphogluconolactonase  31.41 
 
 		 348 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  32.92 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  28.61 
 
 		 377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6529  6-phosphogluconolactonase  31.95 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111343  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1090  6-phosphogluconolactonase  31.61 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  30.87 
 
 		 368 aa  142  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  28.66 
 
 		 353 aa  142  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  31.72 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  28.24 
 
 		 375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  30.03 
 
 		 350 aa  132  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  30.75 
 
 		 355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  28.53 
 
 		 374 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  29.28 
 
 		 354 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  30.12 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  29.86 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  30.12 
 
 		 353 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  30.12 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  27.79 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  31.08 
 
 		 351 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  28.04 
 
 		 354 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  29.48 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  27.54 
 
 		 350 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  33.33 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  29.81 
 
 		 355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  28.26 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  28.57 
 
 		 372 aa  119  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  27.79 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  32.78 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1974  6-phosphogluconolactonase  25.07 
 
 		 340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.290723  normal  0.0128629 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  29.61 
 
 		 355 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  28.57 
 
 		 349 aa  116  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  29.19 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  28.31 
 
 		 353 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  28.62 
 
 		 355 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  30.77 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  32 
 
 		 411 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  32 
 
 		 411 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  31.64 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  31.84 
 
 		 391 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  31.64 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  31.84 
 
 		 391 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  31.84 
 
 		 391 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  29.02 
 
 		 410 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  27.93 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  30.43 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  29.91 
 
 		 384 aa  109  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  30.91 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  30.91 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  30.71 
 
 		 415 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  27.14 
 
 		 404 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  30.71 
 
 		 415 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  30.71 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  30.71 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  30.71 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  27.03 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  25.15 
 
 		 370 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  28.78 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  28.67 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  25.45 
 
 		 342 aa  102  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  30.48 
 
 		 354 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  28.87 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  28.77 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  25 
 
 		 352 aa  99.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  29.39 
 
 		 351 aa  99.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>