139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2199 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5895  3-carboxymuconate cyclase-like  97.71 
 
 
349 aa  672    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2182  3-carboxymuconate cyclase-like protein  97.71 
 
 
349 aa  672    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2199  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
348 aa  692    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5499  3-carboxymuconate cyclase-like  88.83 
 
 
349 aa  613  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2099  6-phosphogluconolactonase  84.81 
 
 
349 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2221  3-carboxymuconate cyclase-like protein  84.24 
 
 
349 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1090  6-phosphogluconolactonase  81.9 
 
 
348 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6529  6-phosphogluconolactonase  50.43 
 
 
359 aa  309  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111343  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  37.28 
 
 
386 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  36.71 
 
 
386 aa  215  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  38.73 
 
 
380 aa  212  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  34.29 
 
 
359 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  35.94 
 
 
363 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  37.5 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  37.5 
 
 
363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  33.81 
 
 
377 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  34.1 
 
 
367 aa  172  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  36.73 
 
 
363 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  36.34 
 
 
363 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1974  6-phosphogluconolactonase  34.51 
 
 
340 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.290723  normal  0.0128629 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  31.41 
 
 
331 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  31.41 
 
 
331 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  31.41 
 
 
331 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  31.41 
 
 
331 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  31.41 
 
 
331 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  31.91 
 
 
331 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  30.55 
 
 
331 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  30.32 
 
 
332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  30.55 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  30.55 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  30.55 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  30.55 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2878  6-phosphogluconolactonase  29.06 
 
 
331 aa  152  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  29.74 
 
 
332 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  30.55 
 
 
331 aa  151  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  30.55 
 
 
331 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  30.26 
 
 
331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  27.62 
 
 
329 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  28.99 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  28.7 
 
 
334 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0244  6-phosphogluconolactonase  27.78 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  30.51 
 
 
350 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  27.03 
 
 
370 aa  99.8  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  26.55 
 
 
349 aa  94.4  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  26.84 
 
 
385 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  23.82 
 
 
373 aa  92.8  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  30.33 
 
 
414 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  26.71 
 
 
431 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  30.1 
 
 
414 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  28.29 
 
 
376 aa  90.1  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  29 
 
 
354 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  28.3 
 
 
380 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  28.3 
 
 
376 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  30.2 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  30.77 
 
 
411 aa  86.3  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  27.47 
 
 
351 aa  85.9  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  28.87 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  28.87 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  28.87 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  23.76 
 
 
368 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  27.3 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  23.78 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  27.79 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  28.57 
 
 
388 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  27.34 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  29.21 
 
 
415 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  28.84 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  29.39 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  29.67 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  30.04 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  25.39 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  29.67 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  29.67 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  30.04 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  29.67 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  29.67 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  23.17 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  27.18 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  27.62 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  26.78 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  23.65 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  25.25 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  27.86 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  29.33 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  23.97 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  25.74 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  23.67 
 
 
372 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  23.58 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  27.94 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  23.89 
 
 
354 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  25.74 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  28.47 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  22.4 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  24.36 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  30.96 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  22.61 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  29.19 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06344  6-phosphogluconolactonase  25.71 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  25.74 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  25.12 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>