165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2933 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  99.7 
 
 		 334 aa  688    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 		 334 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  74.09 
 
 		 331 aa  511  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  69.21 
 
 		 332 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  67.99 
 
 		 332 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2878  6-phosphogluconolactonase  64.94 
 
 		 331 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  64.33 
 
 		 329 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  58.66 
 
 		 331 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  58.66 
 
 		 331 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  57.45 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  58.66 
 
 		 331 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  58.66 
 
 		 331 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  58.36 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  56.53 
 
 		 331 aa  381  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  56.53 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  56.53 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  56.53 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  56.53 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  56.53 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  56.23 
 
 		 331 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0244  6-phosphogluconolactonase  46.36 
 
 		 333 aa  315  6e-85  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  39.31 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  39.51 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  38.79 
 
 		 363 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  39.21 
 
 		 375 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  39.21 
 
 		 363 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  41.03 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  39.34 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  36.31 
 
 		 386 aa  211  9e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  36.02 
 
 		 386 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  30.75 
 
 		 377 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  31.32 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  32.63 
 
 		 373 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  29.63 
 
 		 353 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  30.66 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2221  3-carboxymuconate cyclase-like protein  29.97 
 
 		 349 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2099  6-phosphogluconolactonase  30.17 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6529  6-phosphogluconolactonase  31.76 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111343  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5895  3-carboxymuconate cyclase-like  29.48 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2182  3-carboxymuconate cyclase-like protein  29.48 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  28.93 
 
 		 342 aa  136  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  30.41 
 
 		 350 aa  135  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5499  3-carboxymuconate cyclase-like  28.53 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2199  6-phosphogluconolactonase  28.7 
 
 		 348 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1090  6-phosphogluconolactonase  28.95 
 
 		 348 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  30.09 
 
 		 348 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  30.66 
 
 		 412 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  30 
 
 		 376 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  28.92 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  25.65 
 
 		 375 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  27.3 
 
 		 404 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  29.02 
 
 		 350 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  29.65 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  29.52 
 
 		 410 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  26.55 
 
 		 355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  28.53 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  30.31 
 
 		 351 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  27.24 
 
 		 354 aa  119  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  26.33 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  26.46 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  26.55 
 
 		 355 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  26.99 
 
 		 355 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  27.59 
 
 		 349 aa  115  8.999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  27.38 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  26.55 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  27.3 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  26.69 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  29.8 
 
 		 372 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  26.69 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  31.2 
 
 		 411 aa  113  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  32 
 
 		 411 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  32 
 
 		 411 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  31.6 
 
 		 411 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  31.6 
 
 		 411 aa  112  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  31.6 
 
 		 391 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  31.6 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  31.6 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  28.27 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  25.33 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  27.03 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  30.3 
 
 		 380 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  24.69 
 
 		 352 aa  109  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  27.04 
 
 		 351 aa  109  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  30.3 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  30.33 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  24.93 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  30.65 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.799827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  27.83 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  27.05 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1349  6-phosphogluconolactonase  27.68 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000593187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  31.05 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  29.1 
 
 		 342 aa  105  9e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  29.93 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  27.36 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  30 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  30 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  30 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  29.2 
 
 		 414 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  24.93 
 
 		 370 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  28.19 
 
 		 431 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>