179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6126 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  89.53 
 
 		 375 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  732    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  89.53 
 
 		 363 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  97.8 
 
 		 363 aa  679    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  51.19 
 
 		 363 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  50.88 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  44.17 
 
 		 386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  43.85 
 
 		 380 aa  279  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  43.89 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  37.4 
 
 		 377 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  38.03 
 
 		 359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  39.82 
 
 		 331 aa  235  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  39.51 
 
 		 334 aa  225  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  39.51 
 
 		 334 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  38.14 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2878  6-phosphogluconolactonase  38.74 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  37.13 
 
 		 332 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  38.48 
 
 		 329 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  36.78 
 
 		 331 aa  209  9e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  35.74 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  35.74 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  35.74 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  35.74 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  35.74 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  36.45 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  36.14 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  36.14 
 
 		 331 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  36.14 
 
 		 331 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  36.14 
 
 		 331 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  36.14 
 
 		 331 aa  194  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  36.14 
 
 		 331 aa  192  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6529  6-phosphogluconolactonase  37.01 
 
 		 359 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111343  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0244  6-phosphogluconolactonase  32.13 
 
 		 333 aa  184  3e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2221  3-carboxymuconate cyclase-like protein  37.39 
 
 		 349 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2099  6-phosphogluconolactonase  36.44 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5499  3-carboxymuconate cyclase-like  36.02 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5895  3-carboxymuconate cyclase-like  36.49 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2182  3-carboxymuconate cyclase-like protein  36.49 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1090  6-phosphogluconolactonase  36.42 
 
 		 348 aa  169  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2199  6-phosphogluconolactonase  36.34 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  33.64 
 
 		 353 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1974  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.290723  normal  0.0128629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  32.1 
 
 		 376 aa  143  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  30.98 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  30.42 
 
 		 390 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  30.89 
 
 		 354 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  31.29 
 
 		 376 aa  136  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  30.11 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  32.79 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  29.14 
 
 		 373 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  32.45 
 
 		 415 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32.45 
 
 		 415 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  32.45 
 
 		 415 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  33.57 
 
 		 412 aa  132  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  29.64 
 
 		 370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  31.47 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  32.35 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  32.79 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  32.64 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  30.97 
 
 		 374 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  31.75 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  29.57 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  31.48 
 
 		 375 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  30.98 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  30.98 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  29.29 
 
 		 349 aa  124  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  32.25 
 
 		 414 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  28.91 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  33.77 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  28.66 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  34.63 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  34.63 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  34.63 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  34.63 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  34.63 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  34.3 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  34.3 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  27.94 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  27.95 
 
 		 404 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  32.49 
 
 		 385 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  25.62 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  30.7 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  28.45 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  32.38 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  30.56 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  31.22 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  30.14 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  30.67 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  30.14 
 
 		 376 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  31.56 
 
 		 431 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  30.85 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  25.47 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  27.74 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  29.75 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  28.12 
 
 		 351 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  27.14 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  25.23 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  26.9 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  27.99 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  32.39 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>